76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7427 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7427  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 329 aa  638    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1257  ArsR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 320 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0962048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8781  transcriptional regulator, ArsR family  38.64 
 
 		 329 aa  169  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8265  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6759  normal  0.106103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2607  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.17 
 
 		 325 aa  166  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334204  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5726  transcriptional regulator, MarR family  38.23 
 
 		 333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367585  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6816  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5278  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.26 
 
 		 315 aa  156  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101617 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5350  transcriptional regulator, ArsR family  38.51 
 
 		 299 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.762712  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7744  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.77 
 
 		 322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20560  ArsR family regulatory protein  35.21 
 
 		 326 aa  145  9e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2939  hypothetical protein  33.83 
 
 		 348 aa  143  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188076  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2604  regulatory protein ArsR  33.84 
 
 		 328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000170459  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8435  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 355 aa  135  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.927236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5309  transcriptional regulator, ArsR family  31.89 
 
 		 318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0987  transcriptional regulator, ArsR family  35.06 
 
 		 328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3074  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 331 aa  129  9.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4678  ArsR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604348  normal  0.332683 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3343  transcriptional regulator, ArsR family  33.23 
 
 		 325 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1068  transcriptional regulator, ArsR family  29.6 
 
 		 329 aa  125  8.000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4248  regulatory protein, ArsR  33.13 
 
 		 329 aa  122  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257853  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02260  hypothetical protein  35.28 
 
 		 315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7936  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.63 
 
 		 328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209211  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01320  hypothetical protein  32.21 
 
 		 321 aa  116  6e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4515  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.52 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.980218  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8175  hypothetical protein  32.99 
 
 		 324 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2023  transcriptional regulator, ArsR family  28.37 
 
 		 339 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968345  normal  0.0622762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3806  transcriptional regulator, ArsR family  32.27 
 
 		 334 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7857  regulatory protein ArsR  31.91 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4137  transcriptional regulator, ArsR family  29.53 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.121483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0416  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.49 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4199  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.37 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000654261  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6022  transcriptional regulator, ArsR family  30.45 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3377  transcriptional regulator, MarR family  27.09 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0559363  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2987  transcriptional regulator, ArsR family  32.57 
 
 		 323 aa  67  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375969  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3060  regulatory protein ArsR  32.46 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241489  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0374  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.86 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4238  ArsR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 358 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.499229  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3521  ArsR family transcriptional regulator  20.6 
 
 		 368 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7771  putative transcriptional regulator, ArsR family  26.62 
 
 		 333 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5266  transcriptional regulator, ArsR family  20.3 
 
 		 368 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4648  putative transcriptional regulator, ArsR family  26.76 
 
 		 359 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39269  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5360  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.01 
 
 		 337 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624321  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1142  transcriptional regulator, ArsR family  46.3 
 
 		 109 aa  47  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.629326  normal  0.465859 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4187  transcriptional regulator, ArsR family  25.9 
 
 		 365 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal  0.285545 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 100 aa  47  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1391  transcriptional regulator, ArsR family  41.51 
 
 		 85 aa  46.6  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000018666  unclonable  0.00000780162 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2324  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 94 aa  46.6  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3321  transcriptional regulator, ArsR family  24.22 
 
 		 350 aa  46.6  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 133 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  52.5 
 
 		 120 aa  46.2  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 120 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 135 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  50 
 
 		 118 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3634  regulatory protein, ArsR  46.3 
 
 		 94 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 120 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 104 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 120 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 		 119 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1683  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 113 aa  45.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 115 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 118 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 118 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  50 
 
 		 110 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  40.82 
 
 		 133 aa  44.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1405  hypothetical protein  35.59 
 
 		 208 aa  44.3  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.179835  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 122 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0341  ArsR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 114 aa  44.3  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000827961  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 112 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2679  regulatory protein ArsR  50 
 
 		 120 aa  43.5  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00320886  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  33.7 
 
 		 122 aa  43.1  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  45.61 
 
 		 106 aa  43.1  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  33.71 
 
 		 125 aa  43.1  0.007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2744  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 124 aa  42.7  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  42.22 
 
 		 142 aa  42.7  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  42.22 
 
 		 142 aa  42.7  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>