43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6816 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6816  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 326 aa  635    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2939  hypothetical protein  58.02 
 
 		 348 aa  356  2.9999999999999997e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188076  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2604  regulatory protein ArsR  42.77 
 
 		 328 aa  238  8e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000170459  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1257  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 320 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0962048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2607  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.12 
 
 		 325 aa  199  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334204  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7744  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.67 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8265  transcriptional regulator, ArsR family  35.28 
 
 		 330 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6759  normal  0.106103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5278  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.1 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101617 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4248  regulatory protein, ArsR  37.65 
 
 		 329 aa  172  7.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257853  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7936  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.46 
 
 		 328 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209211  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4678  ArsR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 329 aa  168  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604348  normal  0.332683 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1068  transcriptional regulator, ArsR family  34.45 
 
 		 329 aa  161  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8781  transcriptional regulator, ArsR family  37.31 
 
 		 329 aa  159  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3343  transcriptional regulator, ArsR family  36.42 
 
 		 325 aa  156  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01320  hypothetical protein  35.6 
 
 		 321 aa  155  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5726  transcriptional regulator, MarR family  36.45 
 
 		 333 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367585  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7427  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.15 
 
 		 329 aa  149  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8435  transcriptional regulator, MarR family  35.31 
 
 		 355 aa  145  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.927236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5309  transcriptional regulator, ArsR family  31.55 
 
 		 318 aa  139  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20560  ArsR family regulatory protein  31.17 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02260  hypothetical protein  33.23 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5350  transcriptional regulator, ArsR family  34.08 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.762712  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0987  transcriptional regulator, ArsR family  33.13 
 
 		 328 aa  129  7.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3074  transcriptional regulator, MarR family  32.92 
 
 		 331 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4515  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.8 
 
 		 326 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.980218  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8175  hypothetical protein  33.84 
 
 		 324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5360  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.22 
 
 		 337 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624321  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4199  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.03 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000654261  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3806  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2023  transcriptional regulator, ArsR family  31.3 
 
 		 339 aa  96.3  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968345  normal  0.0622762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0374  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.72 
 
 		 325 aa  95.9  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4137  transcriptional regulator, ArsR family  29.66 
 
 		 326 aa  92.8  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.121483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7771  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.51 
 
 		 333 aa  92.8  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7857  regulatory protein ArsR  31.07 
 
 		 331 aa  90.5  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6022  transcriptional regulator, ArsR family  31 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0416  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.8 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2987  transcriptional regulator, ArsR family  29.97 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375969  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4648  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.23 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39269  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3060  regulatory protein ArsR  31.27 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241489  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3377  transcriptional regulator, MarR family  25.59 
 
 		 328 aa  53.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0559363  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4187  transcriptional regulator, ArsR family  26.61 
 
 		 365 aa  49.3  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal  0.285545 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2010  histidinol-phosphate aminotransferase  32.64 
 
 		 357 aa  44.3  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.450874  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4238  ArsR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 358 aa  43.5  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.499229  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>