47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4515 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4515  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 326 aa  652    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.980218  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5360  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.65 
 
 		 337 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624321  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0374  putative transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 		 325 aa  228  8e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3806  transcriptional regulator, ArsR family  44.86 
 
 		 334 aa  220  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7771  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.99 
 
 		 333 aa  219  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2987  transcriptional regulator, ArsR family  43.08 
 
 		 323 aa  196  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375969  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3060  regulatory protein ArsR  42.24 
 
 		 313 aa  182  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241489  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8175  hypothetical protein  38.89 
 
 		 324 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0416  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.31 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2604  regulatory protein ArsR  31.1 
 
 		 328 aa  129  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000170459  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1257  ArsR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0962048 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5726  transcriptional regulator, MarR family  33.74 
 
 		 333 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367585  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2939  hypothetical protein  30.79 
 
 		 348 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188076  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6022  transcriptional regulator, ArsR family  33.23 
 
 		 319 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8265  transcriptional regulator, ArsR family  29.82 
 
 		 330 aa  115  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6759  normal  0.106103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5278  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.8 
 
 		 315 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2607  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.13 
 
 		 325 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334204  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6816  ArsR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 326 aa  112  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5309  transcriptional regulator, ArsR family  29.67 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8781  transcriptional regulator, ArsR family  31.18 
 
 		 329 aa  109  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7744  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.3 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5350  transcriptional regulator, ArsR family  32.39 
 
 		 299 aa  99  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.762712  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7427  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.52 
 
 		 329 aa  96.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3074  transcriptional regulator, MarR family  32.1 
 
 		 331 aa  95.1  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1068  transcriptional regulator, ArsR family  28.75 
 
 		 329 aa  93.6  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3343  transcriptional regulator, ArsR family  29.36 
 
 		 325 aa  90.9  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02260  hypothetical protein  28.57 
 
 		 315 aa  90.5  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20560  ArsR family regulatory protein  29.23 
 
 		 326 aa  90.1  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0987  transcriptional regulator, ArsR family  28.9 
 
 		 328 aa  90.1  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01320  hypothetical protein  31.4 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7857  regulatory protein ArsR  32.43 
 
 		 331 aa  86.3  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4248  regulatory protein, ArsR  28.27 
 
 		 329 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257853  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4678  ArsR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604348  normal  0.332683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8435  transcriptional regulator, MarR family  28.42 
 
 		 355 aa  80.5  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.927236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2023  transcriptional regulator, ArsR family  28.45 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968345  normal  0.0622762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7936  putative transcriptional regulator, ArsR family  27.02 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209211  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4199  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.02 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000654261  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3377  transcriptional regulator, MarR family  24.6 
 
 		 328 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0559363  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3371  hypothetical protein  24.71 
 
 		 255 aa  46.6  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00157866  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  44 
 
 		 142 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2275  ArsR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 105 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137847 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 		 142 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5679  hypothetical protein  43.75 
 
 		 63 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4051  regulatory protein, ArsR  30.43 
 
 		 104 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125954  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4356  transcriptional regulator, ArsR family  31.52 
 
 		 104 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4648  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.43 
 
 		 359 aa  43.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39269  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1284  ArsR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 100 aa  42.7  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>