44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7771 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7771  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 333 aa  668    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5360  putative transcriptional regulator, ArsR family  59.82 
 
 		 337 aa  363  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624321  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4515  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.99 
 
 		 326 aa  219  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.980218  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3806  transcriptional regulator, ArsR family  37.69 
 
 		 334 aa  183  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0374  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.81 
 
 		 325 aa  169  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2987  transcriptional regulator, ArsR family  39.32 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375969  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3060  regulatory protein ArsR  37.69 
 
 		 313 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241489  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8175  hypothetical protein  33.54 
 
 		 324 aa  133  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1257  ArsR family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0962048 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20560  ArsR family regulatory protein  29.52 
 
 		 326 aa  96.3  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6816  ArsR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 326 aa  92.8  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0416  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 279 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5726  transcriptional regulator, MarR family  30.32 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367585  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2604  regulatory protein ArsR  27.79 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000170459  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7936  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.31 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209211  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3343  transcriptional regulator, ArsR family  29.92 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2939  hypothetical protein  27.65 
 
 		 348 aa  79.3  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188076  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8265  transcriptional regulator, ArsR family  26.69 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6759  normal  0.106103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2607  putative transcriptional regulator, ArsR family  27.88 
 
 		 325 aa  76.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334204  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1068  transcriptional regulator, ArsR family  27.15 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7744  putative transcriptional regulator, ArsR family  27.88 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4678  ArsR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604348  normal  0.332683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5679  hypothetical protein  64.15 
 
 		 63 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6022  transcriptional regulator, ArsR family  27.25 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8435  transcriptional regulator, MarR family  27.17 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.927236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2023  transcriptional regulator, ArsR family  28.17 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968345  normal  0.0622762 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5309  transcriptional regulator, ArsR family  26.99 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02260  hypothetical protein  27.81 
 
 		 315 aa  65.9  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4248  regulatory protein, ArsR  27.62 
 
 		 329 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257853  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0987  transcriptional regulator, ArsR family  27.79 
 
 		 328 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3074  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01320  hypothetical protein  28.47 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5278  putative transcriptional regulator, ArsR family  25.33 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101617 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8781  transcriptional regulator, ArsR family  26.07 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3521  ArsR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5266  transcriptional regulator, ArsR family  23.96 
 
 		 368 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7857  regulatory protein ArsR  29.58 
 
 		 331 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7427  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.19 
 
 		 329 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5350  transcriptional regulator, ArsR family  29.25 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.762712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4137  transcriptional regulator, ArsR family  26.32 
 
 		 326 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.121483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3321  transcriptional regulator, ArsR family  36.61 
 
 		 350 aa  46.6  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4648  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.87 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39269  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4238  ArsR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 358 aa  43.1  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.499229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3377  transcriptional regulator, MarR family  26.58 
 
 		 328 aa  42.7  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0559363  normal  0.372748 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>