40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4137 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4137  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 326 aa  640    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.121483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4678  ArsR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 329 aa  164  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604348  normal  0.332683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7936  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 		 328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209211  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4248  regulatory protein, ArsR  36.16 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257853  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4199  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.42 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000654261  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2939  hypothetical protein  32.11 
 
 		 348 aa  122  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188076  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02260  hypothetical protein  30.15 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8435  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 355 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.927236 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2604  regulatory protein ArsR  32.72 
 
 		 328 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000170459  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5726  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367585  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1257  ArsR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0962048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7744  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.74 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8265  transcriptional regulator, ArsR family  29.55 
 
 		 330 aa  113  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6759  normal  0.106103 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0987  transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 		 328 aa  112  9e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5278  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.48 
 
 		 315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101617 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3074  transcriptional regulator, MarR family  31.12 
 
 		 331 aa  109  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2607  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.82 
 
 		 325 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334204  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6816  ArsR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 326 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3343  transcriptional regulator, ArsR family  30.38 
 
 		 325 aa  103  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8781  transcriptional regulator, ArsR family  30.54 
 
 		 329 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1068  transcriptional regulator, ArsR family  29.48 
 
 		 329 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01320  hypothetical protein  30.95 
 
 		 321 aa  96.7  5e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2023  transcriptional regulator, ArsR family  29.31 
 
 		 339 aa  96.7  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968345  normal  0.0622762 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5309  transcriptional regulator, ArsR family  28.82 
 
 		 318 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20560  ArsR family regulatory protein  29.04 
 
 		 326 aa  92.4  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7427  putative transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 		 329 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5350  transcriptional regulator, ArsR family  28.39 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.762712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3377  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 		 328 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0559363  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5360  putative transcriptional regulator, ArsR family  27.74 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624321  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8175  hypothetical protein  27.22 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7771  putative transcriptional regulator, ArsR family  26.49 
 
 		 333 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0374  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.17 
 
 		 325 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7857  regulatory protein ArsR  26.05 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 125 aa  50.1  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3819  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 		 120 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4515  putative transcriptional regulator, ArsR family  25.68 
 
 		 326 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.980218  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0416  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.63 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3806  transcriptional regulator, ArsR family  27.72 
 
 		 334 aa  43.9  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2744  transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 		 124 aa  43.9  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4982  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.55 
 
 		 111 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>