51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5278 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5278  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 315 aa  613  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7744  putative transcriptional regulator, ArsR family  68.27 
 
 		 322 aa  384  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8265  transcriptional regulator, ArsR family  54.92 
 
 		 330 aa  331  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6759  normal  0.106103 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1257  ArsR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 320 aa  237  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0962048 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2604  regulatory protein ArsR  43.22 
 
 		 328 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000170459  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2607  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.77 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334204  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2939  hypothetical protein  39.87 
 
 		 348 aa  193  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188076  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6816  ArsR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 326 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20560  ArsR family regulatory protein  38.14 
 
 		 326 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8435  transcriptional regulator, MarR family  38.58 
 
 		 355 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.927236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8781  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 		 329 aa  176  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5726  transcriptional regulator, MarR family  37.7 
 
 		 333 aa  170  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367585  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7427  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.94 
 
 		 329 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02260  hypothetical protein  36.62 
 
 		 315 aa  160  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1068  transcriptional regulator, ArsR family  32.8 
 
 		 329 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3343  transcriptional regulator, ArsR family  38.41 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5309  transcriptional regulator, ArsR family  33.98 
 
 		 318 aa  152  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01320  hypothetical protein  35.9 
 
 		 321 aa  142  7e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4248  regulatory protein, ArsR  35.2 
 
 		 329 aa  140  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257853  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4678  ArsR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 329 aa  138  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604348  normal  0.332683 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3074  transcriptional regulator, MarR family  35.83 
 
 		 331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0987  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7936  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.76 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209211  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4515  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.12 
 
 		 326 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.980218  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5350  transcriptional regulator, ArsR family  33.55 
 
 		 299 aa  122  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.762712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4137  transcriptional regulator, ArsR family  32.2 
 
 		 326 aa  108  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.121483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2023  transcriptional regulator, ArsR family  31.02 
 
 		 339 aa  99  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968345  normal  0.0622762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4199  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.44 
 
 		 323 aa  96.3  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000654261  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3806  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 334 aa  95.9  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5360  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.81 
 
 		 337 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624321  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0374  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.55 
 
 		 325 aa  85.9  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8175  hypothetical protein  30.22 
 
 		 324 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6022  transcriptional regulator, ArsR family  30.3 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7857  regulatory protein ArsR  30.37 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2987  transcriptional regulator, ArsR family  29.35 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375969  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0416  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.37 
 
 		 279 aa  67  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3060  regulatory protein ArsR  32.04 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241489  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4648  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.74 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39269  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7771  putative transcriptional regulator, ArsR family  25.48 
 
 		 333 aa  62.4  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3377  transcriptional regulator, MarR family  26.21 
 
 		 328 aa  55.8  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0559363  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4238  ArsR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 358 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.499229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4187  transcriptional regulator, ArsR family  26.8 
 
 		 365 aa  49.7  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal  0.285545 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  36.84 
 
 		 133 aa  47.4  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 135 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3321  transcriptional regulator, ArsR family  31.82 
 
 		 350 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  40.32 
 
 		 227 aa  45.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 104 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  48.15 
 
 		 119 aa  43.5  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1683  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 113 aa  43.5  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 115 aa  43.1  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 125 aa  42.7  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>