43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2604 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2604  regulatory protein ArsR  100 
 
 
328 aa  633  1e-180  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000170459  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2939  hypothetical protein  42.28 
 
 
348 aa  247  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188076  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6816  ArsR family transcriptional regulator  42.77 
 
 
326 aa  238  8e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1257  ArsR family transcriptional regulator  40.8 
 
 
320 aa  223  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0962048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5278  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.22 
 
 
315 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.101617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2607  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.36 
 
 
325 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334204  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7744  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.91 
 
 
322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275052  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8265  transcriptional regulator, ArsR family  34.94 
 
 
330 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6759  normal  0.106103 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5309  transcriptional regulator, ArsR family  35.65 
 
 
318 aa  176  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1068  transcriptional regulator, ArsR family  34.76 
 
 
329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3343  transcriptional regulator, ArsR family  37.77 
 
 
325 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4248  regulatory protein, ArsR  37.8 
 
 
329 aa  162  6e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257853  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4678  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
329 aa  162  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604348  normal  0.332683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8781  transcriptional regulator, ArsR family  36.45 
 
 
329 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20560  ArsR family regulatory protein  37.65 
 
 
326 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5726  transcriptional regulator, MarR family  35.52 
 
 
333 aa  152  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367585  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8435  transcriptional regulator, MarR family  33.43 
 
 
355 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.927236 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01320  hypothetical protein  35.19 
 
 
321 aa  149  5e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7936  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.78 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209211  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02260  hypothetical protein  35.6 
 
 
315 aa  140  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4515  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.1 
 
 
326 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.980218  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7427  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.13 
 
 
329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3074  transcriptional regulator, MarR family  35.58 
 
 
331 aa  127  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8175  hypothetical protein  33.84 
 
 
324 aa  126  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0987  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 
328 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4199  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.06 
 
 
323 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000654261  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5350  transcriptional regulator, ArsR family  33.44 
 
 
299 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.762712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4137  transcriptional regulator, ArsR family  31.89 
 
 
326 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.121483  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2023  transcriptional regulator, ArsR family  33.52 
 
 
339 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968345  normal  0.0622762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3806  transcriptional regulator, ArsR family  31.15 
 
 
334 aa  90.9  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0374  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.55 
 
 
325 aa  88.6  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5360  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.16 
 
 
337 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624321  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7771  putative transcriptional regulator, ArsR family  27.79 
 
 
333 aa  83.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7857  regulatory protein ArsR  31.42 
 
 
331 aa  80.5  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2987  transcriptional regulator, ArsR family  30.61 
 
 
323 aa  73.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375969  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6022  transcriptional regulator, ArsR family  29.75 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.873498  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4648  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.12 
 
 
359 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39269  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3060  regulatory protein ArsR  34.04 
 
 
313 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241489  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3377  transcriptional regulator, MarR family  25.75 
 
 
328 aa  63.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0559363  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4187  transcriptional regulator, ArsR family  27.62 
 
 
365 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal  0.285545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0416  putative transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 
279 aa  56.2  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2984  putative transcriptional regulator, ArsR family  57.5 
 
 
97 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2723  putative transcriptional regulator, ArsR family  57.5 
 
 
97 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0152441  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>