61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5350 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5350  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 299 aa  570  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.762712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8781  transcriptional regulator, ArsR family  38.41 
 
 		 329 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1257  ArsR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 320 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0962048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7427  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.22 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7744  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.6 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2607  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.13 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334204  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8265  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 		 330 aa  135  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6759  normal  0.106103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6816  ArsR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02260  hypothetical protein  35.71 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5309  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5278  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.65 
 
 		 315 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101617 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3343  transcriptional regulator, ArsR family  34.08 
 
 		 325 aa  115  7.999999999999999e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2939  hypothetical protein  32.59 
 
 		 348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188076  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0987  transcriptional regulator, ArsR family  33.54 
 
 		 328 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2604  regulatory protein ArsR  33.44 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000170459  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5726  transcriptional regulator, MarR family  31.46 
 
 		 333 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367585  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20560  ArsR family regulatory protein  32.8 
 
 		 326 aa  103  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3074  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 331 aa  103  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4515  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.39 
 
 		 326 aa  99  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.980218  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8435  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 		 355 aa  95.9  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.927236 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1068  transcriptional regulator, ArsR family  31.11 
 
 		 329 aa  95.5  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01320  hypothetical protein  33.21 
 
 		 321 aa  93.2  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7936  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.35 
 
 		 328 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209211  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8175  hypothetical protein  32.71 
 
 		 324 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4678  ArsR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604348  normal  0.332683 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4248  regulatory protein, ArsR  29.94 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257853  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0374  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.69 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7857  regulatory protein ArsR  31.35 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0416  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.68 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5360  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.89 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624321  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4199  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.67 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000654261  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2987  transcriptional regulator, ArsR family  34.65 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375969  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3806  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 334 aa  58.9  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3060  regulatory protein ArsR  32.54 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241489  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6022  transcriptional regulator, ArsR family  47.37 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4137  transcriptional regulator, ArsR family  27.4 
 
 		 326 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.121483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2023  transcriptional regulator, ArsR family  29.64 
 
 		 339 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968345  normal  0.0622762 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5266  transcriptional regulator, ArsR family  23.56 
 
 		 368 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3521  ArsR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 368 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7771  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.25 
 
 		 333 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4187  transcriptional regulator, ArsR family  28.69 
 
 		 365 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal  0.285545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.44 
 
 		 116 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 115 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3377  transcriptional regulator, MarR family  27.22 
 
 		 328 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0559363  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 		 104 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  33.96 
 
 		 107 aa  43.9  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2744  transcriptional regulator, ArsR family  44.62 
 
 		 124 aa  43.9  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 119 aa  44.3  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  40.28 
 
 		 107 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1142  transcriptional regulator, ArsR family  49.06 
 
 		 109 aa  43.9  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.629326  normal  0.465859 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  44.62 
 
 		 100 aa  43.9  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  33.96 
 
 		 107 aa  43.9  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 115 aa  43.5  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0341  ArsR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 114 aa  42.7  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000827961  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  50 
 
 		 116 aa  43.1  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4480  transcriptional regulator, ArsR family  65.79 
 
 		 152 aa  42.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0205  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 104 aa  42.7  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 107 aa  42.7  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20650  transcriptional regulator, ArsR family  48.94 
 
 		 119 aa  42.4  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  58.33 
 
 		 104 aa  42.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2324  transcriptional regulator, ArsR family  44.9 
 
 		 94 aa  42.4  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>