47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3343 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3343  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 325 aa  631  1e-180  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1068  transcriptional regulator, ArsR family  48.15 
 
 		 329 aa  294  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1257  ArsR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0962048 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01320  hypothetical protein  38.72 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2939  hypothetical protein  35.09 
 
 		 348 aa  166  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188076  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2604  regulatory protein ArsR  37.77 
 
 		 328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000170459  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6816  ArsR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 326 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20560  ArsR family regulatory protein  33.64 
 
 		 326 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2607  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.62 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334204  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02260  hypothetical protein  36.14 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5278  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101617 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8265  transcriptional regulator, ArsR family  32.7 
 
 		 330 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6759  normal  0.106103 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5309  transcriptional regulator, ArsR family  33.12 
 
 		 318 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7744  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.38 
 
 		 322 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8781  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 329 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5726  transcriptional regulator, MarR family  31.14 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367585  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7427  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.23 
 
 		 329 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5350  transcriptional regulator, ArsR family  34.08 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.762712  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7936  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.62 
 
 		 328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209211  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8175  hypothetical protein  32.98 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0987  transcriptional regulator, ArsR family  33.63 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8435  transcriptional regulator, MarR family  32.75 
 
 		 355 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.927236 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4678  ArsR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604348  normal  0.332683 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4248  regulatory protein, ArsR  30.15 
 
 		 329 aa  97.4  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257853  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4137  transcriptional regulator, ArsR family  29.69 
 
 		 326 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.121483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3074  transcriptional regulator, MarR family  32.48 
 
 		 331 aa  92.8  8e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4515  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.36 
 
 		 326 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.980218  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0416  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.41 
 
 		 279 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3806  transcriptional regulator, ArsR family  31.54 
 
 		 334 aa  85.1  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4199  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.7 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000654261  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7857  regulatory protein ArsR  30.56 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7771  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.92 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2023  transcriptional regulator, ArsR family  29.85 
 
 		 339 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968345  normal  0.0622762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5360  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.17 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624321  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0374  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.6 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6022  transcriptional regulator, ArsR family  28.35 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2987  transcriptional regulator, ArsR family  30.86 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375969  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3060  regulatory protein ArsR  32.68 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241489  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4648  putative transcriptional regulator, ArsR family  26.25 
 
 		 359 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39269  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4187  transcriptional regulator, ArsR family  26.71 
 
 		 365 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal  0.285545 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3521  ArsR family transcriptional regulator  18.75 
 
 		 368 aa  47  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3377  transcriptional regulator, MarR family  27.68 
 
 		 328 aa  46.6  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0559363  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  50.94 
 
 		 218 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5266  transcriptional regulator, ArsR family  18.45 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2235  transcriptional regulator, ArsR family  42.19 
 
 		 117 aa  44.3  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167964  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 223 aa  43.1  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>