34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3377 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3377  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 328 aa  660    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0559363  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4678  ArsR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604348  normal  0.332683 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4248  regulatory protein, ArsR  30.5 
 
 		 329 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257853  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1257  ArsR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0962048 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2939  hypothetical protein  28.09 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188076  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2607  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.87 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334204  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02260  hypothetical protein  28.17 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5726  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367585  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2604  regulatory protein ArsR  25.75 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000170459  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8175  hypothetical protein  27.73 
 
 		 324 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7427  putative transcriptional regulator, ArsR family  27.09 
 
 		 329 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3074  transcriptional regulator, MarR family  25.54 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4137  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.121483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7936  putative transcriptional regulator, ArsR family  26.15 
 
 		 328 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209211  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5278  putative transcriptional regulator, ArsR family  26.21 
 
 		 315 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101617 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8781  transcriptional regulator, ArsR family  28.72 
 
 		 329 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5360  putative transcriptional regulator, ArsR family  26.05 
 
 		 337 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624321  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0374  putative transcriptional regulator, ArsR family  26.81 
 
 		 325 aa  53.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0416  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.33 
 
 		 279 aa  53.5  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6816  ArsR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 326 aa  53.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8435  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 355 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.927236 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20560  ArsR family regulatory protein  26.67 
 
 		 326 aa  50.4  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5309  transcriptional regulator, ArsR family  24.92 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1068  transcriptional regulator, ArsR family  24.08 
 
 		 329 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7744  putative transcriptional regulator, ArsR family  25.97 
 
 		 322 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01320  hypothetical protein  26.86 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6022  transcriptional regulator, ArsR family  26.46 
 
 		 319 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0987  transcriptional regulator, ArsR family  25.38 
 
 		 328 aa  47.4  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4515  putative transcriptional regulator, ArsR family  24.6 
 
 		 326 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.980218  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3343  transcriptional regulator, ArsR family  27.68 
 
 		 325 aa  46.6  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5350  transcriptional regulator, ArsR family  27.22 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.762712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8265  transcriptional regulator, ArsR family  25.54 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6759  normal  0.106103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2023  transcriptional regulator, ArsR family  25.53 
 
 		 339 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968345  normal  0.0622762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7771  putative transcriptional regulator, ArsR family  26.58 
 
 		 333 aa  42.7  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>