40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0987 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0987  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 328 aa  646    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3074  transcriptional regulator, MarR family  57.14 
 
 		 331 aa  350  1e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5726  transcriptional regulator, MarR family  42.04 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367585  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1257  ArsR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 320 aa  170  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0962048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8435  transcriptional regulator, MarR family  37.06 
 
 		 355 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.927236 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02260  hypothetical protein  33.95 
 
 		 315 aa  135  8e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8265  transcriptional regulator, ArsR family  34.15 
 
 		 330 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6759  normal  0.106103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2607  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 		 325 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334204  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7427  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.94 
 
 		 329 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6816  ArsR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 326 aa  129  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20560  ArsR family regulatory protein  34.55 
 
 		 326 aa  127  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7936  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.25 
 
 		 328 aa  125  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209211  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4678  ArsR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604348  normal  0.332683 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2604  regulatory protein ArsR  35.56 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000170459  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4248  regulatory protein, ArsR  34.05 
 
 		 329 aa  123  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257853  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2939  hypothetical protein  30.51 
 
 		 348 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188076  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5309  transcriptional regulator, ArsR family  32.83 
 
 		 318 aa  119  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7744  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.75 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8781  transcriptional regulator, ArsR family  33.23 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01320  hypothetical protein  32.72 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5278  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.02 
 
 		 315 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101617 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1068  transcriptional regulator, ArsR family  30.56 
 
 		 329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5350  transcriptional regulator, ArsR family  33.54 
 
 		 299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.762712  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3343  transcriptional regulator, ArsR family  33.63 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4199  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.21 
 
 		 323 aa  93.2  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000654261  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4137  transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 		 326 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.121483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2023  transcriptional regulator, ArsR family  30.4 
 
 		 339 aa  90.5  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968345  normal  0.0622762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4515  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.9 
 
 		 326 aa  90.1  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.980218  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8175  hypothetical protein  30.88 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3806  transcriptional regulator, ArsR family  29.64 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5360  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.3 
 
 		 337 aa  72.4  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624321  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7857  regulatory protein ArsR  30.46 
 
 		 331 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7771  putative transcriptional regulator, ArsR family  27.79 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0374  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.56 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2987  transcriptional regulator, ArsR family  28.41 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375969  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0416  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 		 279 aa  50.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6022  transcriptional regulator, ArsR family  25.41 
 
 		 319 aa  50.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3377  transcriptional regulator, MarR family  25.38 
 
 		 328 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0559363  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3060  regulatory protein ArsR  29.33 
 
 		 313 aa  47  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241489  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3321  transcriptional regulator, ArsR family  26.5 
 
 		 350 aa  43.1  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>