38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3060 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3060  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 313 aa  588  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241489  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3806  transcriptional regulator, ArsR family  47.65 
 
 		 334 aa  219  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4515  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.24 
 
 		 326 aa  205  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.980218  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0374  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.51 
 
 		 325 aa  175  8e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5360  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.52 
 
 		 337 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624321  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7771  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.32 
 
 		 333 aa  165  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8175  hypothetical protein  38.21 
 
 		 324 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2987  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375969  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1257  ArsR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0962048 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5726  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 		 333 aa  97.1  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367585  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2939  hypothetical protein  31.49 
 
 		 348 aa  90.9  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188076  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2604  regulatory protein ArsR  34.04 
 
 		 328 aa  90.1  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000170459  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7744  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.86 
 
 		 322 aa  89.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02260  hypothetical protein  32.92 
 
 		 315 aa  87  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6816  ArsR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3343  transcriptional regulator, ArsR family  32.68 
 
 		 325 aa  78.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7427  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.46 
 
 		 329 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0416  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.98 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8781  transcriptional regulator, ArsR family  33.98 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5350  transcriptional regulator, ArsR family  33.56 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.762712  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3074  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5278  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.49 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101617 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4678  ArsR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604348  normal  0.332683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8265  transcriptional regulator, ArsR family  28.48 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6759  normal  0.106103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7936  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.91 
 
 		 328 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209211  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2607  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.7 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334204  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20560  ArsR family regulatory protein  34.55 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4248  regulatory protein, ArsR  30.7 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257853  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01320  hypothetical protein  28.85 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5309  transcriptional regulator, ArsR family  30.75 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6022  transcriptional regulator, ArsR family  33.64 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1068  transcriptional regulator, ArsR family  28.29 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8435  transcriptional regulator, MarR family  29.89 
 
 		 355 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.927236 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0987  transcriptional regulator, ArsR family  29.33 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7857  regulatory protein ArsR  31.96 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4199  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.15 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000654261  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2023  transcriptional regulator, ArsR family  25.65 
 
 		 339 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968345  normal  0.0622762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3377  transcriptional regulator, MarR family  28.51 
 
 		 328 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0559363  normal  0.372748 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>