57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3074 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3074  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 331 aa  651    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0987  transcriptional regulator, ArsR family  57.14 
 
 		 328 aa  350  1e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5726  transcriptional regulator, MarR family  41.92 
 
 		 333 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367585  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1257  ArsR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 320 aa  161  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0962048 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20560  ArsR family regulatory protein  38.96 
 
 		 326 aa  156  6e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8435  transcriptional regulator, MarR family  39 
 
 		 355 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.927236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2607  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 		 325 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334204  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02260  hypothetical protein  34.85 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2604  regulatory protein ArsR  35.58 
 
 		 328 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000170459  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2939  hypothetical protein  34.15 
 
 		 348 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188076  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7427  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.15 
 
 		 329 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5278  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.89 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101617 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6816  ArsR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8265  transcriptional regulator, ArsR family  31.61 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6759  normal  0.106103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7744  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.64 
 
 		 322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4248  regulatory protein, ArsR  33.85 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257853  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4678  ArsR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 329 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604348  normal  0.332683 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5309  transcriptional regulator, ArsR family  31 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8781  transcriptional regulator, ArsR family  33.64 
 
 		 329 aa  106  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5350  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 299 aa  103  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.762712  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01320  hypothetical protein  32.82 
 
 		 321 aa  101  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2023  transcriptional regulator, ArsR family  31.01 
 
 		 339 aa  96.3  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968345  normal  0.0622762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4515  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.1 
 
 		 326 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.980218  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1068  transcriptional regulator, ArsR family  27.02 
 
 		 329 aa  95.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3343  transcriptional regulator, ArsR family  32.48 
 
 		 325 aa  92.8  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4137  transcriptional regulator, ArsR family  31.12 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.121483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4199  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.44 
 
 		 323 aa  89.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000654261  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7936  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.24 
 
 		 328 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209211  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8175  hypothetical protein  29.45 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7857  regulatory protein ArsR  31.31 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3806  transcriptional regulator, ArsR family  30.1 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5360  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.46 
 
 		 337 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624321  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0374  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.65 
 
 		 325 aa  67  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2987  transcriptional regulator, ArsR family  32.08 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375969  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3060  regulatory protein ArsR  32.52 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241489  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3377  transcriptional regulator, MarR family  25.54 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0559363  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0416  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.02 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7771  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.46 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3819  regulatory protein, ArsR  51.79 
 
 		 120 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1062  transcriptional regulator, ArsR family  47.83 
 
 		 103 aa  48.5  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6022  transcriptional regulator, ArsR family  26.33 
 
 		 319 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 120 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 120 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 120 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2718  regulatory protein, ArsR  51.92 
 
 		 131 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4648  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.23 
 
 		 359 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39269  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  31.17 
 
 		 123 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 123 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  43.9 
 
 		 114 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 127 aa  43.9  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  49.02 
 
 		 121 aa  43.5  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1788  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 123 aa  43.1  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0212653 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2541  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 117 aa  43.1  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  46.94 
 
 		 109 aa  42.7  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  37.14 
 
 		 164 aa  42.7  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 104 aa  42.7  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>