47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4678 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4678  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 329 aa  636    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604348  normal  0.332683 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4248  regulatory protein, ArsR  90.58 
 
 		 329 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257853  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7936  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.4 
 
 		 328 aa  252  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209211  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6816  ArsR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2604  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 		 328 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000170459  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2939  hypothetical protein  34.43 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188076  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4137  transcriptional regulator, ArsR family  37.22 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.121483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1257  ArsR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0962048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8435  transcriptional regulator, MarR family  35.91 
 
 		 355 aa  145  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.927236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4199  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000654261  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7744  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.53 
 
 		 322 aa  136  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8781  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 329 aa  129  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5278  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.89 
 
 		 315 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7427  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 		 329 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02260  hypothetical protein  33.13 
 
 		 315 aa  125  8.000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2607  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.02 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334204  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0987  transcriptional regulator, ArsR family  34.56 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8265  transcriptional regulator, ArsR family  30.09 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6759  normal  0.106103 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20560  ArsR family regulatory protein  32.13 
 
 		 326 aa  124  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5726  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 333 aa  119  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367585  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5309  transcriptional regulator, ArsR family  32.21 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8175  hypothetical protein  32.25 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01320  hypothetical protein  32.73 
 
 		 321 aa  110  5e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3074  transcriptional regulator, MarR family  33.54 
 
 		 331 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2023  transcriptional regulator, ArsR family  32.66 
 
 		 339 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968345  normal  0.0622762 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3343  transcriptional regulator, ArsR family  31.27 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1068  transcriptional regulator, ArsR family  27.65 
 
 		 329 aa  93.6  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0374  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.44 
 
 		 325 aa  85.9  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7857  regulatory protein ArsR  32.36 
 
 		 331 aa  85.9  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5350  transcriptional regulator, ArsR family  28.97 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.762712  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5360  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.59 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624321  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3377  transcriptional regulator, MarR family  31.45 
 
 		 328 aa  82.8  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0559363  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4515  putative transcriptional regulator, ArsR family  27.49 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.980218  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6022  transcriptional regulator, ArsR family  31.2 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7771  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.95 
 
 		 333 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3806  transcriptional regulator, ArsR family  31.66 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0416  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.19 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5266  transcriptional regulator, ArsR family  25 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3060  regulatory protein ArsR  30.7 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241489  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3521  ArsR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2987  transcriptional regulator, ArsR family  28.37 
 
 		 323 aa  57  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375969  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4648  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.58 
 
 		 359 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39269  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  38.89 
 
 		 111 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  47.27 
 
 		 114 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 125 aa  43.5  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  47.73 
 
 		 126 aa  43.1  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1041  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 112 aa  42.7  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  0.549476 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>