47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2023 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2023  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 339 aa  671    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968345  normal  0.0622762 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4248  regulatory protein, ArsR  32.39 
 
 		 329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257853  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5726  transcriptional regulator, MarR family  31.1 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367585  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2939  hypothetical protein  31.27 
 
 		 348 aa  108  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188076  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8265  transcriptional regulator, ArsR family  31.53 
 
 		 330 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6759  normal  0.106103 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4678  ArsR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 329 aa  106  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604348  normal  0.332683 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2604  regulatory protein ArsR  33.52 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000170459  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8435  transcriptional regulator, MarR family  30.46 
 
 		 355 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.927236 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1257  ArsR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 320 aa  103  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0962048 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20560  ArsR family regulatory protein  29.23 
 
 		 326 aa  103  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1068  transcriptional regulator, ArsR family  30.37 
 
 		 329 aa  103  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7744  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.46 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8781  transcriptional regulator, ArsR family  31.61 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02260  hypothetical protein  31.61 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5309  transcriptional regulator, ArsR family  30.88 
 
 		 318 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3074  transcriptional regulator, MarR family  31.01 
 
 		 331 aa  96.3  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6816  ArsR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 326 aa  96.3  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5278  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.02 
 
 		 315 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7936  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.21 
 
 		 328 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209211  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0987  transcriptional regulator, ArsR family  30.4 
 
 		 328 aa  90.5  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01320  hypothetical protein  31.09 
 
 		 321 aa  90.5  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2607  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.74 
 
 		 325 aa  89.4  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334204  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4137  transcriptional regulator, ArsR family  28.78 
 
 		 326 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.121483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7427  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.37 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4515  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.45 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.980218  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3343  transcriptional regulator, ArsR family  29.85 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4199  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.4 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000654261  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8175  hypothetical protein  30.83 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7771  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.17 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0416  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.74 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7857  regulatory protein ArsR  28.45 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0374  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5360  putative transcriptional regulator, ArsR family  27.37 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624321  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6022  transcriptional regulator, ArsR family  26.64 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5350  transcriptional regulator, ArsR family  29.64 
 
 		 299 aa  53.5  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.762712  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3806  transcriptional regulator, ArsR family  27.17 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5266  transcriptional regulator, ArsR family  24.62 
 
 		 368 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3521  ArsR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 368 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2159  transcriptional regulator, ArsR family  41.3 
 
 		 131 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679753  normal  0.522465 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2841  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 110 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.268381  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2904  putative transcriptional regulator  41.38 
 
 		 89 aa  45.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2414  transcriptional regulator, ArsR family  36.73 
 
 		 118 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.203968 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2987  transcriptional regulator, ArsR family  43.55 
 
 		 323 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375969  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  34.95 
 
 		 119 aa  43.5  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3377  transcriptional regulator, MarR family  25.53 
 
 		 328 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0559363  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4648  putative transcriptional regulator, ArsR family  26.37 
 
 		 359 aa  43.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39269  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4893  regulatory protein ArsR  47.5 
 
 		 121 aa  43.1  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>