59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6022 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6022  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 319 aa  622  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4515  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.53 
 
 		 326 aa  135  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.980218  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0416  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.75 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0374  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.22 
 
 		 325 aa  122  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8175  hypothetical protein  32.52 
 
 		 324 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20560  ArsR family regulatory protein  30.89 
 
 		 326 aa  105  8e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5360  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.09 
 
 		 337 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624321  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2939  hypothetical protein  31.25 
 
 		 348 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188076  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1257  ArsR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 320 aa  98.2  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0962048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8781  transcriptional regulator, ArsR family  30.23 
 
 		 329 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3806  transcriptional regulator, ArsR family  30.86 
 
 		 334 aa  92.8  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2604  regulatory protein ArsR  30.67 
 
 		 328 aa  90.5  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000170459  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6816  ArsR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 326 aa  89.7  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7771  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.14 
 
 		 333 aa  89.4  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7857  regulatory protein ArsR  31.94 
 
 		 331 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3343  transcriptional regulator, ArsR family  29.79 
 
 		 325 aa  86.7  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4678  ArsR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 329 aa  85.9  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604348  normal  0.332683 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2987  transcriptional regulator, ArsR family  30.25 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375969  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02260  hypothetical protein  29.41 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4248  regulatory protein, ArsR  29.24 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257853  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01320  hypothetical protein  29.65 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7744  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.96 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5278  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.3 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101617 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1068  transcriptional regulator, ArsR family  27.41 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5309  transcriptional regulator, ArsR family  29.01 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7427  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.19 
 
 		 329 aa  75.9  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2607  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.93 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334204  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7936  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.82 
 
 		 328 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209211  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2023  transcriptional regulator, ArsR family  26.57 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968345  normal  0.0622762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8265  transcriptional regulator, ArsR family  24.01 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6759  normal  0.106103 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5726  transcriptional regulator, MarR family  27.41 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367585  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0987  transcriptional regulator, ArsR family  26.07 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3060  regulatory protein ArsR  33.23 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241489  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8435  transcriptional regulator, MarR family  27.97 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.927236 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5350  transcriptional regulator, ArsR family  47.37 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.762712  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3074  transcriptional regulator, MarR family  28.05 
 
 		 331 aa  55.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3377  transcriptional regulator, MarR family  26.52 
 
 		 328 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0559363  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4648  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.94 
 
 		 359 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39269  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  37.31 
 
 		 105 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  45.45 
 
 		 119 aa  47  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5266  transcriptional regulator, ArsR family  23.15 
 
 		 368 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 104 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3640  transcriptional regulator, ArsR family  42.19 
 
 		 113 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3929  transcriptional regulator, ArsR family  42.19 
 
 		 113 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 233 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  40.35 
 
 		 106 aa  45.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4137  transcriptional regulator, ArsR family  29.22 
 
 		 326 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.121483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  38.89 
 
 		 112 aa  43.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  38.89 
 
 		 112 aa  43.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1119  CTP-dependent riboflavin kinase  41.18 
 
 		 219 aa  43.5  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0178918  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 221 aa  43.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  36.36 
 
 		 115 aa  43.1  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3521  ArsR family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 368 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  38.6 
 
 		 125 aa  43.1  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1841  transcriptional regulator, ArsR family  39.44 
 
 		 103 aa  42.7  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0064194  normal  0.0655813 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 227 aa  42.7  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  47.73 
 
 		 142 aa  42.7  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  47.73 
 
 		 142 aa  42.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  40.98 
 
 		 110 aa  42.7  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>