53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5726 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5726  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 333 aa  647    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367585  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1257  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 320 aa  224  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0962048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2607  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.57 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334204  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8435  transcriptional regulator, MarR family  41.39 
 
 		 355 aa  202  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.927236 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3074  transcriptional regulator, MarR family  41.92 
 
 		 331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20560  ArsR family regulatory protein  40.43 
 
 		 326 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02260  hypothetical protein  37.07 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0987  transcriptional regulator, ArsR family  42.04 
 
 		 328 aa  185  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8265  transcriptional regulator, ArsR family  35.6 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6759  normal  0.106103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5278  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.23 
 
 		 315 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7744  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.11 
 
 		 322 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7427  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.81 
 
 		 329 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2604  regulatory protein ArsR  35.52 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000170459  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5309  transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2939  hypothetical protein  35.67 
 
 		 348 aa  162  9e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188076  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6816  ArsR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 326 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8781  transcriptional regulator, ArsR family  37.09 
 
 		 329 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1068  transcriptional regulator, ArsR family  31.63 
 
 		 329 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4515  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.74 
 
 		 326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.980218  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4678  ArsR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604348  normal  0.332683 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3343  transcriptional regulator, ArsR family  31.14 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4248  regulatory protein, ArsR  33.53 
 
 		 329 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257853  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01320  hypothetical protein  33.23 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7936  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.23 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209211  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2023  transcriptional regulator, ArsR family  31.79 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968345  normal  0.0622762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5350  transcriptional regulator, ArsR family  32.49 
 
 		 299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.762712  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5360  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.31 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624321  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4137  transcriptional regulator, ArsR family  32.1 
 
 		 326 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.121483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3806  transcriptional regulator, ArsR family  33.96 
 
 		 334 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8175  hypothetical protein  29.34 
 
 		 324 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7771  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.61 
 
 		 333 aa  89.7  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3060  regulatory protein ArsR  33.23 
 
 		 313 aa  86.7  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241489  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4199  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.02 
 
 		 323 aa  86.7  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000654261  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7857  regulatory protein ArsR  34.83 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0374  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.19 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0416  putative transcriptional regulator, ArsR family  25.55 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3377  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 328 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0559363  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2987  transcriptional regulator, ArsR family  29.85 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375969  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3521  ArsR family transcriptional regulator  22.69 
 
 		 368 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5266  transcriptional regulator, ArsR family  22.69 
 
 		 368 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6022  transcriptional regulator, ArsR family  26.25 
 
 		 319 aa  52.8  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  48.39 
 
 		 114 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2839  metal-regulated homodimeric transcriptional regulator  48 
 
 		 93 aa  46.2  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1788  ArsR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 123 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0212653 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1142  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 109 aa  44.3  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.629326  normal  0.465859 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  44.64 
 
 		 123 aa  43.9  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 120 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  42 
 
 		 93 aa  43.9  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2227  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 103 aa  43.5  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1105  transcriptional regulator, ArsR/dinitrogenase iron-molybdenum cofactor family protein  40.43 
 
 		 244 aa  43.1  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0728142  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3819  regulatory protein, ArsR  36.79 
 
 		 120 aa  43.1  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  35.59 
 
 		 97 aa  42.7  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  42 
 
 		 109 aa  42.7  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>