44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7857 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7857  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 331 aa  649    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8265  transcriptional regulator, ArsR family  30.14 
 
 		 330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6759  normal  0.106103 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1257  ArsR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0962048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7936  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.36 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209211  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4515  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.43 
 
 		 326 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.980218  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20560  ArsR family regulatory protein  32.34 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6816  ArsR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4678  ArsR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604348  normal  0.332683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8781  transcriptional regulator, ArsR family  30.79 
 
 		 329 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4248  regulatory protein, ArsR  31.47 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257853  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5309  transcriptional regulator, ArsR family  32.32 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6022  transcriptional regulator, ArsR family  30.93 
 
 		 319 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8175  hypothetical protein  29.76 
 
 		 324 aa  99.8  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02260  hypothetical protein  29.36 
 
 		 315 aa  99  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2604  regulatory protein ArsR  31.42 
 
 		 328 aa  97.1  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000170459  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3343  transcriptional regulator, ArsR family  30.56 
 
 		 325 aa  96.7  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7427  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.91 
 
 		 329 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1068  transcriptional regulator, ArsR family  29.13 
 
 		 329 aa  94.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8435  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 355 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.927236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7744  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.48 
 
 		 322 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5350  transcriptional regulator, ArsR family  31.35 
 
 		 299 aa  93.2  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.762712  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3074  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 331 aa  91.3  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0416  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.18 
 
 		 279 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2939  hypothetical protein  28.87 
 
 		 348 aa  90.9  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188076  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2607  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.31 
 
 		 325 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334204  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5278  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.85 
 
 		 315 aa  86.3  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101617 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5726  transcriptional regulator, MarR family  34.83 
 
 		 333 aa  83.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367585  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01320  hypothetical protein  30.51 
 
 		 321 aa  82.4  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2023  transcriptional regulator, ArsR family  28.45 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968345  normal  0.0622762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2987  transcriptional regulator, ArsR family  36.6 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375969  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0987  transcriptional regulator, ArsR family  29.94 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5360  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.31 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624321  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7771  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.58 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0374  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.14 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4187  transcriptional regulator, ArsR family  29.92 
 
 		 365 aa  67  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal  0.285545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3806  transcriptional regulator, ArsR family  32.05 
 
 		 334 aa  65.9  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4648  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.98 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39269  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3060  regulatory protein ArsR  34.62 
 
 		 313 aa  53.5  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241489  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4137  transcriptional regulator, ArsR family  24.79 
 
 		 326 aa  53.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.121483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4199  putative transcriptional regulator, ArsR family  26.57 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000654261  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 93 aa  44.3  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 99 aa  44.3  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4445  ArsR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 229 aa  43.5  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3452  ArsR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 234 aa  42.4  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>