48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7936 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7936  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 328 aa  644    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209211  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4248  regulatory protein, ArsR  47.71 
 
 		 329 aa  255  7e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257853  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4678  ArsR family transcriptional regulator  47.4 
 
 		 329 aa  252  5.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604348  normal  0.332683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6816  ArsR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 326 aa  172  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2939  hypothetical protein  35.37 
 
 		 348 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188076  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2604  regulatory protein ArsR  36.78 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000170459  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4137  transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 		 326 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.121483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4199  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 		 323 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000654261  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7744  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.65 
 
 		 322 aa  135  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275052  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1257  ArsR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 320 aa  133  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0962048 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0987  transcriptional regulator, ArsR family  34.25 
 
 		 328 aa  125  9e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02260  hypothetical protein  33.33 
 
 		 315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8265  transcriptional regulator, ArsR family  29.33 
 
 		 330 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6759  normal  0.106103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2607  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 325 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334204  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8435  transcriptional regulator, MarR family  31.67 
 
 		 355 aa  116  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.927236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5278  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.76 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101617 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3343  transcriptional regulator, ArsR family  32.62 
 
 		 325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8781  transcriptional regulator, ArsR family  33.23 
 
 		 329 aa  112  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5726  transcriptional regulator, MarR family  32.93 
 
 		 333 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367585  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7427  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.63 
 
 		 329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5309  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1068  transcriptional regulator, ArsR family  30.06 
 
 		 329 aa  102  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01320  hypothetical protein  29.82 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20560  ArsR family regulatory protein  29.88 
 
 		 326 aa  95.1  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2023  transcriptional regulator, ArsR family  31.21 
 
 		 339 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968345  normal  0.0622762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8175  hypothetical protein  35.57 
 
 		 324 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7857  regulatory protein ArsR  30.36 
 
 		 331 aa  93.2  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3074  transcriptional regulator, MarR family  30.24 
 
 		 331 aa  89  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5350  transcriptional regulator, ArsR family  30.35 
 
 		 299 aa  87  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.762712  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7771  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.31 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3806  transcriptional regulator, ArsR family  33.74 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0374  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.43 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4515  putative transcriptional regulator, ArsR family  27.02 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.980218  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6022  transcriptional regulator, ArsR family  30.62 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5360  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624321  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3060  regulatory protein ArsR  33.91 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241489  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5266  transcriptional regulator, ArsR family  25 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0416  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3377  transcriptional regulator, MarR family  26.15 
 
 		 328 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0559363  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3521  ArsR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 368 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4648  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.18 
 
 		 359 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39269  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3321  transcriptional regulator, ArsR family  28.67 
 
 		 350 aa  49.7  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 104 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4825  regulatory protein, ArsR  38.89 
 
 		 128 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 125 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2987  transcriptional regulator, ArsR family  32.63 
 
 		 323 aa  43.1  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375969  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 115 aa  43.1  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  38.24 
 
 		 106 aa  42.7  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>