53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4248 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4248  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 329 aa  633  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257853  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4678  ArsR family transcriptional regulator  90.58 
 
 		 329 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604348  normal  0.332683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7936  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.71 
 
 		 328 aa  255  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209211  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6816  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 326 aa  172  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2604  regulatory protein ArsR  37.8 
 
 		 328 aa  162  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000170459  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2939  hypothetical protein  33.93 
 
 		 348 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188076  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1257  ArsR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 320 aa  143  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0962048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8435  transcriptional regulator, MarR family  35.4 
 
 		 355 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.927236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4137  transcriptional regulator, ArsR family  36.16 
 
 		 326 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.121483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4199  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.72 
 
 		 323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000654261  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5278  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.2 
 
 		 315 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7744  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.64 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02260  hypothetical protein  33.85 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2607  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.2 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334204  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8781  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 		 329 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8265  transcriptional regulator, ArsR family  29.7 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6759  normal  0.106103 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20560  ArsR family regulatory protein  33.03 
 
 		 326 aa  124  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0987  transcriptional regulator, ArsR family  34.05 
 
 		 328 aa  123  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7427  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.13 
 
 		 329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5309  transcriptional regulator, ArsR family  31.9 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5726  transcriptional regulator, MarR family  33.53 
 
 		 333 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367585  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2023  transcriptional regulator, ArsR family  32.39 
 
 		 339 aa  112  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968345  normal  0.0622762 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01320  hypothetical protein  32.43 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3074  transcriptional regulator, MarR family  33.85 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8175  hypothetical protein  30.32 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3343  transcriptional regulator, ArsR family  30.15 
 
 		 325 aa  97.4  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1068  transcriptional regulator, ArsR family  27.14 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7857  regulatory protein ArsR  31.47 
 
 		 331 aa  82.4  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4515  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.27 
 
 		 326 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.980218  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0374  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.63 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5350  transcriptional regulator, ArsR family  29.94 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.762712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3377  transcriptional regulator, MarR family  30.5 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0559363  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6022  transcriptional regulator, ArsR family  29.83 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5360  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.53 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624321  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7771  putative transcriptional regulator, ArsR family  27.62 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5266  transcriptional regulator, ArsR family  25.39 
 
 		 368 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3521  ArsR family transcriptional regulator  21.58 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3806  transcriptional regulator, ArsR family  30.46 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3060  regulatory protein ArsR  30.7 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241489  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0416  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.41 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4648  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.73 
 
 		 359 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39269  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2987  transcriptional regulator, ArsR family  28.11 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375969  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  43.06 
 
 		 111 aa  49.7  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 115 aa  47  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  47.27 
 
 		 114 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2045  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 112 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2108  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 112 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.777393  normal  0.0654079 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  40.58 
 
 		 119 aa  44.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2062  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 112 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.242619  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 125 aa  44.3  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  42.65 
 
 		 118 aa  43.1  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20650  transcriptional regulator, ArsR family  40.58 
 
 		 119 aa  43.1  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4187  transcriptional regulator, ArsR family  26.99 
 
 		 365 aa  42.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal  0.285545 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>