More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4187 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4187  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 365 aa  723    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal  0.285545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4648  putative transcriptional regulator, ArsR family  70.25 
 
 		 359 aa  474  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39269  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4238  ArsR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 358 aa  157  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.499229  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3521  ArsR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 368 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5266  transcriptional regulator, ArsR family  24.44 
 
 		 368 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3321  transcriptional regulator, ArsR family  26.29 
 
 		 350 aa  86.7  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1257  ArsR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0962048 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2939  hypothetical protein  26.38 
 
 		 348 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188076  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.92 
 
 		 105 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.14 
 
 		 115 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  40.62 
 
 		 87 aa  64.3  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1295  transcriptional regulator, ArsR family  42.47 
 
 		 89 aa  64.7  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.780199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12658  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 119 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  44.19 
 
 		 123 aa  64.3  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  41.11 
 
 		 120 aa  63.5  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2604  regulatory protein ArsR  28.36 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000170459  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2607  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.61 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334204  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  42.35 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 87 aa  62.4  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 103 aa  62.4  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7857  regulatory protein ArsR  29.92 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5350  transcriptional regulator, ArsR family  30.08 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.762712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 85 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 89 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 		 120 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  45.35 
 
 		 112 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  36.19 
 
 		 123 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  39.6 
 
 		 116 aa  62  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0327  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 165 aa  60.8  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.395704  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 125 aa  60.5  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0070  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 		 121 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.521136  normal  0.0282999 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 		 104 aa  60.5  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 99 aa  60.5  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0140  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20560  ArsR family regulatory protein  28.96 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  45.24 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02260  hypothetical protein  35.75 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  33.77 
 
 		 90 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2767  ArsR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 103 aa  59.3  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2154  transcriptional regulator, ArsR family  33.72 
 
 		 129 aa  59.3  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 90 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  41.1 
 
 		 103 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  37.39 
 
 		 135 aa  58.9  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 119 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 96 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 		 124 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002125  transcriptional regulator ArsR family  48.44 
 
 		 111 aa  58.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 116 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 		 113 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 126 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3740  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 124 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4565  transcriptional regulator, ArsR family  39.71 
 
 		 96 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  44.44 
 
 		 112 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6816  ArsR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16640  hypothetical protein  32.93 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  42.31 
 
 		 183 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 90 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 107 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  33.77 
 
 		 90 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  40.74 
 
 		 122 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  33.77 
 
 		 90 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  32.94 
 
 		 107 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 97 aa  57.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8781  transcriptional regulator, ArsR family  26.34 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 123 aa  57.4  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 114 aa  57.4  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  41.03 
 
 		 110 aa  57.4  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 120 aa  57  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 102 aa  57  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 120 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  43.59 
 
 		 120 aa  57  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  39.08 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  44.12 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3343  transcriptional regulator, ArsR family  28.11 
 
 		 325 aa  57  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  37.68 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3346  transcriptional regulator, ArsR family  46.38 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.388028  hitchhiker  0.00866337 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2841  ArsR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.268381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4248  regulatory protein, ArsR  28.12 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257853  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  38.14 
 
 		 127 aa  55.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  40.74 
 
 		 121 aa  55.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2549  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 103 aa  55.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.208067  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 134 aa  55.8  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 		 139 aa  55.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03333  predicted transcriptional regulator  42.19 
 
 		 113 aa  55.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0416  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.28 
 
 		 279 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 120 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0329  ArsR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 88 aa  55.1  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0217385  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  41.27 
 
 		 116 aa  55.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 120 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  33.8 
 
 		 94 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 96 aa  55.1  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>