More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4238 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4238  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 358 aa  699    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.499229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4187  transcriptional regulator, ArsR family  32.97 
 
 		 365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal  0.285545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4648  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 359 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39269  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5266  transcriptional regulator, ArsR family  20.91 
 
 		 368 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3521  ArsR family transcriptional regulator  20.91 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3321  transcriptional regulator, ArsR family  23.93 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  36.99 
 
 		 119 aa  63.9  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 106 aa  60.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  51.56 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  40.58 
 
 		 105 aa  59.3  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 106 aa  58.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  38.03 
 
 		 106 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 85 aa  57  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  31.65 
 
 		 107 aa  54.7  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 120 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4462  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 		 174 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  31.17 
 
 		 132 aa  54.3  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 90 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7427  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.04 
 
 		 329 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 96 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  35.21 
 
 		 103 aa  54.3  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 		 90 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 		 113 aa  53.9  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  34.92 
 
 		 89 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  41.56 
 
 		 118 aa  53.9  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1075  regulatory protein, ArsR  35.21 
 
 		 81 aa  53.9  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122284  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 90 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 		 90 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 		 90 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  37.97 
 
 		 108 aa  53.5  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4581  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 132 aa  53.5  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  40.32 
 
 		 117 aa  53.5  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  43.55 
 
 		 104 aa  53.1  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  35.21 
 
 		 107 aa  53.1  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 87 aa  53.1  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8781  transcriptional regulator, ArsR family  33.17 
 
 		 329 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  38.03 
 
 		 107 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 99 aa  52  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.2 
 
 		 115 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.79 
 
 		 105 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1295  transcriptional regulator, ArsR family  41.27 
 
 		 89 aa  52.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.780199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  40.91 
 
 		 113 aa  52.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 		 125 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  37.1 
 
 		 99 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  32.91 
 
 		 107 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2884  ArsR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 133 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.301684 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  41.77 
 
 		 108 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  33.87 
 
 		 94 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4509  ArsR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 106 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4321  ArsR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 106 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02260  hypothetical protein  33.74 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4169  ArsR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 106 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.559652  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16640  hypothetical protein  32.88 
 
 		 266 aa  51.2  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4655  ArsR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 106 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.337504  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002125  transcriptional regulator ArsR family  45.9 
 
 		 111 aa  51.2  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  36.23 
 
 		 164 aa  51.2  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 105 aa  50.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 123 aa  50.8  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  35.21 
 
 		 121 aa  50.8  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00297  transcriptional regulator  42.62 
 
 		 111 aa  50.8  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0512  regulatory protein ArsR  43.55 
 
 		 124 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.991267  normal  0.111828 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3806  transcriptional regulator, ArsR family  35.51 
 
 		 334 aa  50.1  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 103 aa  50.1  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 125 aa  50.1  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  40.21 
 
 		 126 aa  50.1  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2744  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 124 aa  49.7  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 		 114 aa  49.7  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  33.87 
 
 		 104 aa  49.7  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 111 aa  49.3  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 115 aa  49.7  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 98 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  36.71 
 
 		 104 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 115 aa  48.9  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 		 112 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 114 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  37.7 
 
 		 118 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  34.18 
 
 		 115 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 96 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2833  transcriptional regulator, ArsR family  40.3 
 
 		 97 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.779996 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3702  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 		 196 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 117 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  35.62 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  32.14 
 
 		 118 aa  48.5  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 117 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0140  transcriptional regulator, ArsR family  34.29 
 
 		 135 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 111 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4060  ArsR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 104 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525402  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  34.67 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 		 116 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  33.87 
 
 		 123 aa  48.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 111 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3234  regulatory protein, ArsR  37.7 
 
 		 129 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  27.27 
 
 		 102 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  36.99 
 
 		 113 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  34.67 
 
 		 354 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 437 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2876  ArsR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 134 aa  47.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.557946  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1142  transcriptional regulator, ArsR family  40.3 
 
 		 109 aa  47.8  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.629326  normal  0.465859 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>