97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8781 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8781  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 329 aa  643    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1257  ArsR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0962048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2607  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.63 
 
 		 325 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334204  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8265  transcriptional regulator, ArsR family  37.24 
 
 		 330 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6759  normal  0.106103 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5309  transcriptional regulator, ArsR family  37.76 
 
 		 318 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5278  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.58 
 
 		 315 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7427  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.58 
 
 		 329 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5350  transcriptional regulator, ArsR family  38.41 
 
 		 299 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.762712  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2604  regulatory protein ArsR  36.45 
 
 		 328 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000170459  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6816  ArsR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 326 aa  159  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5726  transcriptional regulator, MarR family  36.61 
 
 		 333 aa  149  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367585  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7744  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.56 
 
 		 322 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2939  hypothetical protein  32.73 
 
 		 348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188076  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8435  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 		 355 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.927236 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1068  transcriptional regulator, ArsR family  32.34 
 
 		 329 aa  135  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4678  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 329 aa  129  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604348  normal  0.332683 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02260  hypothetical protein  34.56 
 
 		 315 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3343  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 325 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4248  regulatory protein, ArsR  34.12 
 
 		 329 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257853  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01320  hypothetical protein  30.77 
 
 		 321 aa  121  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0987  transcriptional regulator, ArsR family  33.23 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20560  ArsR family regulatory protein  30.21 
 
 		 326 aa  113  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7936  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.23 
 
 		 328 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209211  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4515  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.18 
 
 		 326 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.980218  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3074  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 331 aa  106  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2023  transcriptional regulator, ArsR family  31.61 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968345  normal  0.0622762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8175  hypothetical protein  38.14 
 
 		 324 aa  99.8  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4137  transcriptional regulator, ArsR family  30.13 
 
 		 326 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.121483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3806  transcriptional regulator, ArsR family  39.41 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7857  regulatory protein ArsR  30.79 
 
 		 331 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0374  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.12 
 
 		 325 aa  86.3  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6022  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 		 319 aa  86.3  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3521  ArsR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 368 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5266  transcriptional regulator, ArsR family  25.58 
 
 		 368 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5360  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.33 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624321  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4199  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.42 
 
 		 323 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000654261  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0416  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.51 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4648  putative transcriptional regulator, ArsR family  27.25 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39269  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2987  transcriptional regulator, ArsR family  42.39 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375969  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3060  regulatory protein ArsR  33.98 
 
 		 313 aa  57  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241489  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7771  putative transcriptional regulator, ArsR family  26.07 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3377  transcriptional regulator, MarR family  28.72 
 
 		 328 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0559363  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4238  ArsR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 358 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.499229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 104 aa  50.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1841  transcriptional regulator, ArsR family  44.12 
 
 		 103 aa  49.7  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0064194  normal  0.0655813 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  39.33 
 
 		 227 aa  49.3  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  39.24 
 
 		 121 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0205  ArsR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 104 aa  48.1  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 112 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  40.48 
 
 		 107 aa  47.4  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 297 aa  47  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 437 aa  47  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4187  transcriptional regulator, ArsR family  24.8 
 
 		 365 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal  0.285545 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 114 aa  46.6  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  50.79 
 
 		 109 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 123 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 106 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5264  ArsR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 104 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 115 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3317  transcriptional regulator, TrmB  46.15 
 
 		 108 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2215  ArsR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 111 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5353  ArsR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 102 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5643  ArsR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 102 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1877  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 103 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.42284  hitchhiker  0.00584724 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  36.71 
 
 		 121 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  54.76 
 
 		 122 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  36.71 
 
 		 121 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3929  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 113 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1589  ArsR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 115 aa  43.9  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000194684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 112 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 106 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3640  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 113 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 107 aa  44.3  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 125 aa  44.3  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1580  regulatory protein ArsR  34.25 
 
 		 115 aa  44.3  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0014541  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1532  ArsR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 115 aa  43.9  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 109 aa  43.5  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 94 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 140 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4480  transcriptional regulator, ArsR family  49.25 
 
 		 152 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2080  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  40 
 
 		 271 aa  43.5  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 113 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 99 aa  43.5  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  43.08 
 
 		 106 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2235  transcriptional regulator, ArsR family  38.98 
 
 		 117 aa  43.1  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167964  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  45 
 
 		 111 aa  43.1  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2619  transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 		 101 aa  43.1  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276362  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3937  regulatory protein, ArsR  48.21 
 
 		 109 aa  43.1  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 125 aa  43.1  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2570  transcriptional regulator, ArsR family  39.73 
 
 		 116 aa  43.1  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1683  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 113 aa  43.1  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2309  regulatory protein ArsR  44.74 
 
 		 114 aa  42.7  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.374797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6792  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 108 aa  42.7  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.439051  normal  0.0283932 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0251  transcriptional regulator, ArsR family  48.68 
 
 		 120 aa  42.4  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4542  regulatory protein ArsR  49.12 
 
 		 111 aa  42.4  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436444 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2970  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 110 aa  42.7  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0070  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 121 aa  42.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.521136  normal  0.0282999 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>