104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2080 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2080  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  100 
 
 		 271 aa  553  1e-157  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1756  regulatory protein, ArsR  36.41 
 
 		 267 aa  126  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0375  hypothetical protein  28.4 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.191948  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1272  hypothetical protein  29.26 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.708188  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2068  transcriptional regulator, TrmB  34.34 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0760  transcriptional regulator, ArsR family  28.46 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.357604  normal  0.170766 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0660  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 282 aa  94  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0091  hypothetical protein  28.57 
 
 		 244 aa  87.4  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0340  regulatory protein, Crp  30.38 
 
 		 242 aa  86.7  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.659624  normal  0.909155 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2162  regulatory protein, ArsR  28.44 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0234  ArsR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2193  hypothetical protein  28.21 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.135571  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0231  ArsR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1830  hypothetical protein  28.38 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000650312  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1189  regulatory protein, ArsR  26.46 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.581479  decreased coverage  0.00502087 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3377  hypothetical protein  26.27 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000923215  hitchhiker  0.00992163 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1817  hypothetical protein  27.07 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.081876  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3371  hypothetical protein  25.96 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00157866  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1326  transcriptional regulator TrmB  31.65 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000018018 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2012  ArsR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 174 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0583  transcriptional regulator, ArsR family  28.12 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3361  hypothetical protein  24.07 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000089037  normal  0.0139562 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0348  transcriptional regulator, ArsR family  31.3 
 
 		 176 aa  62  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.122504 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0654  hypothetical protein  22.98 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.997113  normal  0.803696 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0650  hypothetical protein  25.4 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2379  transcriptional regulator, MarR family  29.24 
 
 		 485 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1281  ArsR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 154 aa  55.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0435937 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1726  transcriptional regulator, ArsR family  31.4 
 
 		 167 aa  54.7  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0364777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 		 108 aa  51.6  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2910  transcriptional regulator, ArsR family  27.59 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  32.18 
 
 		 109 aa  50.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1674  transcriptional regulator TrmB  25.89 
 
 		 247 aa  50.4  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1733  hypothetical protein  30.63 
 
 		 286 aa  49.3  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0103078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0070  transcriptional regulator, ArsR family  37.14 
 
 		 121 aa  48.9  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.521136  normal  0.0282999 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4201  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 94 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314782  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1407  regulatory protein, ArsR  35.9 
 
 		 92 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3414  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 111 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3079  regulatory protein, ArsR  31.13 
 
 		 110 aa  47.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4239  regulatory protein, ArsR  31.76 
 
 		 110 aa  47.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4418  regulatory protein, ArsR  31.13 
 
 		 138 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0140  transcriptional regulator, ArsR family  34.21 
 
 		 135 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2970  ArsR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 110 aa  46.2  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2627  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 102 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.8267  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0720  regulatory protein ArsR  33.8 
 
 		 116 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.849038  normal  0.217468 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 		 112 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0733  transcriptional regulator, ArsR family  33.8 
 
 		 106 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  38.61 
 
 		 137 aa  45.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6111  transcriptional regulator, ArsR family  32.91 
 
 		 110 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2989  transcription regulator  29.31 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2225  ArsR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 114 aa  44.3  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.666474  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1644  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 97 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1936  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 97 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 111 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4079  transcriptional regulator, MarR family  35.21 
 
 		 118 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0764894  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2994  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 99 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.566931  normal  0.0250812 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2977  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 99 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.623995  normal  0.100497 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2910  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 99 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3099  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 99 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.22781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2267  transcriptional regulator, ArsR family  36.07 
 
 		 118 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000484642 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2641  transcriptional regulator, ArsR family  36.07 
 
 		 113 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.257894  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1102  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 112 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2801  transcriptional regulator, MarR family  26.81 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0540  ArsR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 117 aa  43.9  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2942  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 99 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.130788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8781  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 329 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 120 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5309  transcriptional regulator, ArsR family  42.59 
 
 		 318 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 115 aa  43.5  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3658  transcriptional regulator, ArsR family  30.26 
 
 		 105 aa  43.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  41.67 
 
 		 118 aa  43.5  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3149  regulatory protein ArsR  29.27 
 
 		 109 aa  43.5  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0944  transcriptional regulator, ArsR family  24.6 
 
 		 219 aa  43.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0139266  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3425  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 		 115 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.461956  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  36.21 
 
 		 227 aa  43.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  37.1 
 
 		 113 aa  43.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  35.29 
 
 		 119 aa  43.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3321  transcriptional regulator, ArsR family  32.22 
 
 		 350 aa  43.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3538  transcriptional regulator HlyU  32.47 
 
 		 98 aa  42.7  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2961  ArsR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 98 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318119  normal  0.703465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3043  ArsR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 98 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000176438  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3141  ArsR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 98 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1050  regulatory protein, ArsR  32.47 
 
 		 98 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000242354  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  32.47 
 
 		 98 aa  42.7  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  32.47 
 
 		 98 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3418  regulatory protein ArsR  33.67 
 
 		 99 aa  42.7  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.799155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4671  ArsR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 119 aa  42.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1151  ArsR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 98 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000355977  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2227  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 103 aa  42.7  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3239  transcriptional regulator, ArsR family  32.47 
 
 		 98 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00078895  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0062  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 113 aa  42.7  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  34.55 
 
 		 227 aa  42.7  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 133 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7180  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 108 aa  42.7  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2878  transcriptional regulator, MarR family  40.32 
 
 		 112 aa  42.7  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1965  ArsR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 120 aa  42.4  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2832  regulatory protein, ArsR  39.34 
 
 		 128 aa  42.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.119331 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 437 aa  42.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3941  regulatory protein ArsR  39.06 
 
 		 99 aa  42.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>