53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_20560 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_20560  ArsR family regulatory protein  100 
 
 		 326 aa  629  1e-179  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02260  hypothetical protein  41.01 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5726  transcriptional regulator, MarR family  40.43 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367585  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1257  ArsR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 320 aa  187  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0962048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5278  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101617 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8265  transcriptional regulator, ArsR family  34.89 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6759  normal  0.106103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8435  transcriptional regulator, MarR family  36.01 
 
 		 355 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.927236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2607  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.08 
 
 		 325 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334204  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2604  regulatory protein ArsR  37.65 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000170459  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3074  transcriptional regulator, MarR family  38.96 
 
 		 331 aa  156  6e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3343  transcriptional regulator, ArsR family  33.64 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7744  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.35 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7427  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.02 
 
 		 329 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2939  hypothetical protein  32.6 
 
 		 348 aa  139  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188076  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6816  ArsR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1068  transcriptional regulator, ArsR family  30.12 
 
 		 329 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5309  transcriptional regulator, ArsR family  31 
 
 		 318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0987  transcriptional regulator, ArsR family  34.55 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4678  ArsR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 329 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604348  normal  0.332683 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4248  regulatory protein, ArsR  33.03 
 
 		 329 aa  124  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257853  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01320  hypothetical protein  32.81 
 
 		 321 aa  123  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8781  transcriptional regulator, ArsR family  30.21 
 
 		 329 aa  113  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5360  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.83 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624321  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5350  transcriptional regulator, ArsR family  32.8 
 
 		 299 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.762712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2023  transcriptional regulator, ArsR family  29.23 
 
 		 339 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968345  normal  0.0622762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7771  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.52 
 
 		 333 aa  96.3  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7936  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.88 
 
 		 328 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209211  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7857  regulatory protein ArsR  32.34 
 
 		 331 aa  93.2  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4515  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.23 
 
 		 326 aa  90.1  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.980218  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8175  hypothetical protein  31.56 
 
 		 324 aa  89.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0416  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.43 
 
 		 279 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4199  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.5 
 
 		 323 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000654261  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6022  transcriptional regulator, ArsR family  29.66 
 
 		 319 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4137  transcriptional regulator, ArsR family  29.04 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.121483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0374  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.74 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3060  regulatory protein ArsR  34.87 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241489  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4648  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.32 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39269  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3806  transcriptional regulator, ArsR family  30.31 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5266  transcriptional regulator, ArsR family  22.52 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3521  ArsR family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2987  transcriptional regulator, ArsR family  38.39 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375969  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3377  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 328 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0559363  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  49.15 
 
 		 110 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 125 aa  47  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3321  transcriptional regulator, ArsR family  24.61 
 
 		 350 aa  47  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4238  ArsR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 358 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.499229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4187  transcriptional regulator, ArsR family  28.36 
 
 		 365 aa  46.2  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal  0.285545 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4571  regulatory protein ArsR  43.06 
 
 		 168 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2853  putative transcriptional regulator  47.54 
 
 		 193 aa  45.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  decreased coverage  0.00327558 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0746  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 210 aa  44.3  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 135 aa  43.9  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0248  regulatory protein ArsR  39.02 
 
 		 109 aa  43.1  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0712  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 121 aa  42.7  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>