65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0374 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0374  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 325 aa  628  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4515  putative transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 		 326 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.980218  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3806  transcriptional regulator, ArsR family  43.08 
 
 		 334 aa  210  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5360  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.64 
 
 		 337 aa  205  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624321  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7771  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.12 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2987  transcriptional regulator, ArsR family  42.56 
 
 		 323 aa  185  8e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375969  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3060  regulatory protein ArsR  45.51 
 
 		 313 aa  174  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241489  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8175  hypothetical protein  38.34 
 
 		 324 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2939  hypothetical protein  33.13 
 
 		 348 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188076  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6022  transcriptional regulator, ArsR family  36.22 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0416  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6816  ArsR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7744  putative transcriptional regulator, ArsR family  32 
 
 		 322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275052  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1257  ArsR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0962048 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01320  hypothetical protein  32.57 
 
 		 321 aa  109  6e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2604  regulatory protein ArsR  31.55 
 
 		 328 aa  105  9e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000170459  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8781  transcriptional regulator, ArsR family  38.12 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4678  ArsR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 329 aa  103  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604348  normal  0.332683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8265  transcriptional regulator, ArsR family  27.3 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6759  normal  0.106103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5278  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.87 
 
 		 315 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2607  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.6 
 
 		 325 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334204  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5309  transcriptional regulator, ArsR family  32.31 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4248  regulatory protein, ArsR  34.63 
 
 		 329 aa  97.4  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257853  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5350  transcriptional regulator, ArsR family  32.69 
 
 		 299 aa  95.9  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.762712  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02260  hypothetical protein  32.82 
 
 		 315 aa  95.9  9e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7936  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.83 
 
 		 328 aa  92.4  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209211  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1068  transcriptional regulator, ArsR family  31.82 
 
 		 329 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20560  ArsR family regulatory protein  31.63 
 
 		 326 aa  90.5  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5726  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 333 aa  89.7  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367585  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3343  transcriptional regulator, ArsR family  30.51 
 
 		 325 aa  88.2  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7427  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.52 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2023  transcriptional regulator, ArsR family  28.45 
 
 		 339 aa  82.4  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968345  normal  0.0622762 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3074  transcriptional regulator, MarR family  30.65 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8435  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 		 355 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.927236 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0987  transcriptional regulator, ArsR family  29.79 
 
 		 328 aa  73.6  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3377  transcriptional regulator, MarR family  26.81 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0559363  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7857  regulatory protein ArsR  32.14 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4137  transcriptional regulator, ArsR family  28.9 
 
 		 326 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.121483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4648  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 		 359 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39269  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4187  transcriptional regulator, ArsR family  33.63 
 
 		 365 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal  0.285545 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  48 
 
 		 100 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 122 aa  47  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2855  ArsR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 265 aa  47  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.832664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3425  transcriptional regulator, ArsR family  34.67 
 
 		 115 aa  47  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.461956  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 104 aa  47  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4238  ArsR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 358 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.499229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 143 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  48.94 
 
 		 113 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0720  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 116 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.849038  normal  0.217468 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 136 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1560  regulatory protein ArsR  38.98 
 
 		 180 aa  44.3  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.964745  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  37.08 
 
 		 142 aa  43.9  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  46.43 
 
 		 127 aa  43.9  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  37.08 
 
 		 142 aa  43.9  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1168  transcriptional regulator, ArsR family  39.71 
 
 		 122 aa  43.5  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315565  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  37.35 
 
 		 142 aa  43.1  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0733  transcriptional regulator, ArsR family  37.31 
 
 		 106 aa  43.1  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  43.86 
 
 		 138 aa  43.1  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5380  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 117 aa  43.1  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0967  ArsR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 181 aa  43.1  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0777  transcriptional regulator, ArsR family  41.51 
 
 		 267 aa  42.7  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  34.67 
 
 		 94 aa  42.7  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 104 aa  43.1  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3369  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 116 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  34.29 
 
 		 103 aa  42.4  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>