40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_01320 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_01320  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  624  1e-178  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1068  transcriptional regulator, ArsR family  37.61 
 
 		 329 aa  196  5.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1257  ArsR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0962048 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3343  transcriptional regulator, ArsR family  38.72 
 
 		 325 aa  180  4e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6816  ArsR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 326 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2939  hypothetical protein  33.64 
 
 		 348 aa  159  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188076  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2604  regulatory protein ArsR  35.19 
 
 		 328 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000170459  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2607  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.95 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334204  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8265  transcriptional regulator, ArsR family  32.42 
 
 		 330 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6759  normal  0.106103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5278  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 		 315 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7744  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.27 
 
 		 322 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20560  ArsR family regulatory protein  32.81 
 
 		 326 aa  129  8.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8781  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 		 329 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02260  hypothetical protein  32.43 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8435  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 		 355 aa  126  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.927236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5726  transcriptional regulator, MarR family  34.45 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367585  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0987  transcriptional regulator, ArsR family  32.72 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4248  regulatory protein, ArsR  32.33 
 
 		 329 aa  119  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257853  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4678  ArsR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 329 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604348  normal  0.332683 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5309  transcriptional regulator, ArsR family  32.28 
 
 		 318 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7427  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.21 
 
 		 329 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3074  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8175  hypothetical protein  32.1 
 
 		 324 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7936  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.52 
 
 		 328 aa  105  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209211  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0374  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.57 
 
 		 325 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4515  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.07 
 
 		 326 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.980218  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2023  transcriptional regulator, ArsR family  31.09 
 
 		 339 aa  97.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968345  normal  0.0622762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5350  transcriptional regulator, ArsR family  33.58 
 
 		 299 aa  96.7  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.762712  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4199  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.23 
 
 		 323 aa  93.2  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000654261  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4137  transcriptional regulator, ArsR family  30.95 
 
 		 326 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.121483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0416  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.89 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6022  transcriptional regulator, ArsR family  28.68 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7857  regulatory protein ArsR  30.51 
 
 		 331 aa  76.3  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3806  transcriptional regulator, ArsR family  31.75 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2987  transcriptional regulator, ArsR family  28.05 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375969  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5360  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.5 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624321  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7771  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.47 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3060  regulatory protein ArsR  29.84 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241489  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3377  transcriptional regulator, MarR family  27.46 
 
 		 328 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0559363  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  48.72 
 
 		 119 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>