56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8435 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8435  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 355 aa  701    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.927236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5726  transcriptional regulator, MarR family  41.39 
 
 		 333 aa  190  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367585  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1257  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 320 aa  189  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0962048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2607  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.39 
 
 		 325 aa  176  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334204  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8265  transcriptional regulator, ArsR family  36.5 
 
 		 330 aa  170  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6759  normal  0.106103 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02260  hypothetical protein  37.05 
 
 		 315 aa  166  8e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5278  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.58 
 
 		 315 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101617 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20560  ArsR family regulatory protein  36.01 
 
 		 326 aa  161  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2604  regulatory protein ArsR  33.43 
 
 		 328 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000170459  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0987  transcriptional regulator, ArsR family  37.06 
 
 		 328 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3074  transcriptional regulator, MarR family  39 
 
 		 331 aa  147  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4678  ArsR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 329 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604348  normal  0.332683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6816  ArsR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 326 aa  145  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7744  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.05 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4248  regulatory protein, ArsR  35.4 
 
 		 329 aa  140  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257853  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8781  transcriptional regulator, ArsR family  33.63 
 
 		 329 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7427  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 		 329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5309  transcriptional regulator, ArsR family  32.14 
 
 		 318 aa  129  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2939  hypothetical protein  31.14 
 
 		 348 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188076  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1068  transcriptional regulator, ArsR family  29.52 
 
 		 329 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01320  hypothetical protein  32.52 
 
 		 321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7936  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.67 
 
 		 328 aa  116  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209211  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3343  transcriptional regulator, ArsR family  32.75 
 
 		 325 aa  106  8e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2023  transcriptional regulator, ArsR family  30.46 
 
 		 339 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968345  normal  0.0622762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4137  transcriptional regulator, ArsR family  31.86 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.121483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5350  transcriptional regulator, ArsR family  32.74 
 
 		 299 aa  95.9  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.762712  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4199  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.84 
 
 		 323 aa  89.4  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000654261  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7857  regulatory protein ArsR  30.77 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4515  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.42 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.980218  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8175  hypothetical protein  29.29 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3806  transcriptional regulator, ArsR family  31.97 
 
 		 334 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0416  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.07 
 
 		 279 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7771  putative transcriptional regulator, ArsR family  27.17 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5360  putative transcriptional regulator, ArsR family  27.4 
 
 		 337 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624321  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0374  putative transcriptional regulator, ArsR family  27.91 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2987  transcriptional regulator, ArsR family  27.48 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375969  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5266  transcriptional regulator, ArsR family  23.76 
 
 		 368 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3521  ArsR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 368 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3377  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 328 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0559363  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6022  transcriptional regulator, ArsR family  26.82 
 
 		 319 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1142  transcriptional regulator, ArsR family  50.94 
 
 		 109 aa  50.1  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.629326  normal  0.465859 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3060  regulatory protein ArsR  29.52 
 
 		 313 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241489  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0559  regulatory protein, ArsR  38.16 
 
 		 123 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0567484  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3513  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 109 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  44.26 
 
 		 107 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2744  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 		 124 aa  44.3  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2227  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 		 103 aa  43.5  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3452  ArsR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 234 aa  43.5  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1168  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 		 122 aa  43.1  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315565  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0113  ArsR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 429 aa  42.7  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2839  metal-regulated homodimeric transcriptional regulator  42.11 
 
 		 93 aa  42.7  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2289  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 109 aa  42.7  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371607 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4655  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 106 aa  42.7  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.337504  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4169  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 106 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.559652  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4321  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 106 aa  42.7  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4509  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 106 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>