56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7744 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7744  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 322 aa  629  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5278  putative transcriptional regulator, ArsR family  68.27 
 
 		 315 aa  381  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101617 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8265  transcriptional regulator, ArsR family  54.71 
 
 		 330 aa  339  4e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6759  normal  0.106103 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1257  ArsR family transcriptional regulator  45.06 
 
 		 320 aa  236  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0962048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2607  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.3 
 
 		 325 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334204  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6816  ArsR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 326 aa  203  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2604  regulatory protein ArsR  38.91 
 
 		 328 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000170459  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2939  hypothetical protein  38.39 
 
 		 348 aa  192  8e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188076  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5309  transcriptional regulator, ArsR family  36.83 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5726  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367585  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20560  ArsR family regulatory protein  35.35 
 
 		 326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8435  transcriptional regulator, MarR family  37.05 
 
 		 355 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.927236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8781  transcriptional regulator, ArsR family  34.56 
 
 		 329 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5350  transcriptional regulator, ArsR family  36.6 
 
 		 299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.762712  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7427  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.24 
 
 		 329 aa  152  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02260  hypothetical protein  36.42 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3343  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7936  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.65 
 
 		 328 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209211  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4678  ArsR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 329 aa  140  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604348  normal  0.332683 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1068  transcriptional regulator, ArsR family  30.09 
 
 		 329 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01320  hypothetical protein  34.58 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4248  regulatory protein, ArsR  32.35 
 
 		 329 aa  132  7.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257853  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0987  transcriptional regulator, ArsR family  34.06 
 
 		 328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3074  transcriptional regulator, MarR family  33.95 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4515  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.3 
 
 		 326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.980218  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4199  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 		 323 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000654261  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4137  transcriptional regulator, ArsR family  32.89 
 
 		 326 aa  109  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.121483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2023  transcriptional regulator, ArsR family  32.46 
 
 		 339 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968345  normal  0.0622762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3806  transcriptional regulator, ArsR family  34.53 
 
 		 334 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8175  hypothetical protein  30.18 
 
 		 324 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0374  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.11 
 
 		 325 aa  96.7  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5360  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.84 
 
 		 337 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624321  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7857  regulatory protein ArsR  30.09 
 
 		 331 aa  82.4  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7771  putative transcriptional regulator, ArsR family  27.88 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6022  transcriptional regulator, ArsR family  28.01 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0416  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.09 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3060  regulatory protein ArsR  33.86 
 
 		 313 aa  72.4  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241489  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2987  transcriptional regulator, ArsR family  28.53 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375969  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5266  transcriptional regulator, ArsR family  23 
 
 		 368 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3521  ArsR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 368 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4238  ArsR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 358 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.499229  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  49.25 
 
 		 119 aa  50.1  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3377  transcriptional regulator, MarR family  25.97 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0559363  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 104 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 227 aa  47.8  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3634  regulatory protein, ArsR  52.17 
 
 		 94 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 125 aa  46.6  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 115 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  56.1 
 
 		 218 aa  43.9  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20650  transcriptional regulator, ArsR family  44.78 
 
 		 119 aa  43.9  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  49.15 
 
 		 112 aa  43.9  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  43.28 
 
 		 119 aa  42.7  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  46 
 
 		 113 aa  42.4  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 117 aa  42.4  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3321  transcriptional regulator, ArsR family  40.98 
 
 		 350 aa  42.4  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6743  transcriptional regulator, ArsR family  33.85 
 
 		 137 aa  42.4  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.661837 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>