103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3806 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3806  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 334 aa  653    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4515  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.29 
 
 		 326 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.980218  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5360  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.94 
 
 		 337 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624321  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0374  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.11 
 
 		 325 aa  199  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3060  regulatory protein ArsR  48.77 
 
 		 313 aa  199  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241489  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2987  transcriptional regulator, ArsR family  44.68 
 
 		 323 aa  192  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375969  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7771  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.92 
 
 		 333 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8175  hypothetical protein  35.82 
 
 		 324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6816  ArsR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 326 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7744  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.41 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5726  transcriptional regulator, MarR family  35.06 
 
 		 333 aa  99  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367585  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5309  transcriptional regulator, ArsR family  33.53 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1257  ArsR family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 320 aa  97.4  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0962048 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2939  hypothetical protein  30.95 
 
 		 348 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188076  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0416  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.63 
 
 		 279 aa  94  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6022  transcriptional regulator, ArsR family  32.63 
 
 		 319 aa  93.6  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2604  regulatory protein ArsR  33.84 
 
 		 328 aa  92.8  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000170459  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8781  transcriptional regulator, ArsR family  36.19 
 
 		 329 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8265  transcriptional regulator, ArsR family  30.52 
 
 		 330 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6759  normal  0.106103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5278  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.21 
 
 		 315 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101617 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1068  transcriptional regulator, ArsR family  32.03 
 
 		 329 aa  89.4  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3343  transcriptional regulator, ArsR family  31.84 
 
 		 325 aa  88.6  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2607  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.23 
 
 		 325 aa  87  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334204  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7427  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.68 
 
 		 329 aa  86.7  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8435  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 		 355 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.927236 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0987  transcriptional regulator, ArsR family  29.87 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7936  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.98 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209211  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01320  hypothetical protein  31.94 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3074  transcriptional regulator, MarR family  30.65 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02260  hypothetical protein  33.68 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4678  ArsR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 329 aa  73.2  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604348  normal  0.332683 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5350  transcriptional regulator, ArsR family  32.41 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.762712  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4248  regulatory protein, ArsR  30.68 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257853  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20560  ArsR family regulatory protein  30.45 
 
 		 326 aa  62.4  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7857  regulatory protein ArsR  32.03 
 
 		 331 aa  53.1  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5380  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 		 117 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 125 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4238  ArsR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 358 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.499229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4648  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.43 
 
 		 359 aa  50.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39269  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2023  transcriptional regulator, ArsR family  27.17 
 
 		 339 aa  49.3  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968345  normal  0.0622762 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5264  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 104 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1841  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 		 103 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0064194  normal  0.0655813 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5353  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 102 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5643  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 102 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  41.67 
 
 		 131 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02523  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.51 
 
 		 99 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1016  transcriptional regulator, ArsR family  36.51 
 
 		 99 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 297 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2802  ArsR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 99 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2947  ArsR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 99 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1039  ArsR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 99 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02487  hypothetical protein  36.51 
 
 		 99 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3425  transcriptional regulator, ArsR family  35.53 
 
 		 115 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.461956  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3521  ArsR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 368 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3214  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 99 aa  47.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4077  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 99 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0520951  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5266  transcriptional regulator, ArsR family  43.33 
 
 		 368 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2787  ArsR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 99 aa  47  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.255483 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3909  transcriptional regulator, ArsR family  34.92 
 
 		 99 aa  47  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.305368 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  35.94 
 
 		 118 aa  46.6  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2970  ArsR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 110 aa  46.6  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3162  regulatory protein, ArsR  38.24 
 
 		 97 aa  46.2  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4199  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.74 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000654261  normal  0.0545475 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  30.12 
 
 		 115 aa  45.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 104 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  43.55 
 
 		 114 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1407  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 		 92 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  43.55 
 
 		 114 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 104 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 114 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  43.55 
 
 		 114 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3377  transcriptional regulator, MarR family  24.57 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0559363  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  40.62 
 
 		 105 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 111 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0937  ArsR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 115 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  35.48 
 
 		 133 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0359  ArsR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 115 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3414  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 		 111 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3372  regulatory protein, ArsR  38.24 
 
 		 106 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110528 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0445  ArsR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 115 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0202  ArsR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 115 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1900  ArsR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 115 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428282  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1814  ArsR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 115 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1404  ArsR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 115 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  41.67 
 
 		 142 aa  44.3  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2619  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 101 aa  43.9  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276362  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  44.44 
 
 		 109 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4201  ArsR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 94 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314782  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1936  ArsR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 97 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  39.68 
 
 		 97 aa  43.5  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  37.84 
 
 		 106 aa  43.5  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3827  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 125 aa  43.1  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 103 aa  43.1  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  34.43 
 
 		 94 aa  43.1  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  38.57 
 
 		 108 aa  42.7  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0532  arsenical resistence operon repressor  41.94 
 
 		 114 aa  42.7  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2096  ArsR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 255 aa  42.7  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  28.17 
 
 		 119 aa  42.7  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2994  regulatory protein ArsR  35 
 
 		 99 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.566931  normal  0.0250812 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2942  regulatory protein ArsR  35 
 
 		 99 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.130788 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>