59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2987 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2987  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 323 aa  627  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375969  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4515  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.08 
 
 		 326 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.980218  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3806  transcriptional regulator, ArsR family  44.72 
 
 		 334 aa  210  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0374  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.73 
 
 		 325 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5360  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.98 
 
 		 337 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624321  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7771  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.32 
 
 		 333 aa  172  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3060  regulatory protein ArsR  40.18 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241489  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8175  hypothetical protein  36.92 
 
 		 324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1257  ArsR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 320 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0962048 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2939  hypothetical protein  29.57 
 
 		 348 aa  105  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188076  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0416  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.78 
 
 		 279 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2607  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.06 
 
 		 325 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334204  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2604  regulatory protein ArsR  30.61 
 
 		 328 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000170459  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6022  transcriptional regulator, ArsR family  29.94 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6816  ArsR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 326 aa  89.4  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3343  transcriptional regulator, ArsR family  30.82 
 
 		 325 aa  87  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5309  transcriptional regulator, ArsR family  29.52 
 
 		 318 aa  86.3  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4678  ArsR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 329 aa  85.9  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604348  normal  0.332683 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5350  transcriptional regulator, ArsR family  32.27 
 
 		 299 aa  85.9  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.762712  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3074  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5278  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.03 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101617 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4248  regulatory protein, ArsR  28.91 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257853  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8265  transcriptional regulator, ArsR family  27.11 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6759  normal  0.106103 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0987  transcriptional regulator, ArsR family  30.86 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01320  hypothetical protein  27.78 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7427  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.21 
 
 		 329 aa  73.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8781  transcriptional regulator, ArsR family  28.41 
 
 		 329 aa  72.8  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02260  hypothetical protein  27.54 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7744  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.27 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5726  transcriptional regulator, MarR family  32.24 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367585  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1068  transcriptional regulator, ArsR family  29.08 
 
 		 329 aa  65.9  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7857  regulatory protein ArsR  36.6 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8435  transcriptional regulator, MarR family  28.16 
 
 		 355 aa  62.8  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.927236 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20560  ArsR family regulatory protein  38.71 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7936  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.28 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209211  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 99 aa  49.7  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  46.03 
 
 		 100 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1433  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 105 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.662802 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2023  transcriptional regulator, ArsR family  27.31 
 
 		 339 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968345  normal  0.0622762 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 		 112 aa  47  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4648  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.83 
 
 		 359 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39269  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  43.94 
 
 		 119 aa  47  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4238  ArsR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 358 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.499229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4060  ArsR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 104 aa  46.2  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525402  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 104 aa  45.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 93 aa  45.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1641  protein tyrosine phosphatase  35.96 
 
 		 309 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  40.62 
 
 		 107 aa  44.3  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1684  transcriptional regulator, ArsR family  34.85 
 
 		 104 aa  44.3  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4187  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 		 365 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal  0.285545 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 104 aa  43.9  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12658  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 119 aa  43.1  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  36.84 
 
 		 118 aa  42.7  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  33.78 
 
 		 108 aa  42.7  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4074  transcriptional regulator, ArsR family  44.78 
 
 		 118 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00570943  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 125 aa  42.7  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  36.23 
 
 		 103 aa  42.7  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2420  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.08 
 
 		 226 aa  42.4  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.544065  normal  0.018861 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2796  transcriptional regulator, ArsR family  43.08 
 
 		 226 aa  42.4  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>