45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8265 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8265  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 330 aa  667    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6759  normal  0.106103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7744  putative transcriptional regulator, ArsR family  54.71 
 
 		 322 aa  324  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5278  putative transcriptional regulator, ArsR family  54.92 
 
 		 315 aa  316  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101617 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1257  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 320 aa  206  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0962048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2607  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.77 
 
 		 325 aa  192  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334204  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8781  transcriptional regulator, ArsR family  37.24 
 
 		 329 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6816  ArsR family transcriptional regulator  35.28 
 
 		 326 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2604  regulatory protein ArsR  34.94 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000170459  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5309  transcriptional regulator, ArsR family  35.69 
 
 		 318 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8435  transcriptional regulator, MarR family  36.5 
 
 		 355 aa  170  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.927236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2939  hypothetical protein  33.13 
 
 		 348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188076  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7427  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.03 
 
 		 329 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20560  ArsR family regulatory protein  34.89 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5726  transcriptional regulator, MarR family  34.98 
 
 		 333 aa  162  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367585  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02260  hypothetical protein  33.13 
 
 		 315 aa  149  9e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3343  transcriptional regulator, ArsR family  32.7 
 
 		 325 aa  143  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01320  hypothetical protein  32.42 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5350  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 		 299 aa  135  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.762712  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0987  transcriptional regulator, ArsR family  34.15 
 
 		 328 aa  132  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4678  ArsR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604348  normal  0.332683 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4248  regulatory protein, ArsR  29.7 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257853  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1068  transcriptional regulator, ArsR family  28 
 
 		 329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7936  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.33 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209211  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4515  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.82 
 
 		 326 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.980218  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3074  transcriptional regulator, MarR family  31.61 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2023  transcriptional regulator, ArsR family  31.53 
 
 		 339 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968345  normal  0.0622762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8175  hypothetical protein  28.02 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4137  transcriptional regulator, ArsR family  29.04 
 
 		 326 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.121483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7857  regulatory protein ArsR  30.14 
 
 		 331 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4199  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.14 
 
 		 323 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000654261  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3806  transcriptional regulator, ArsR family  30.67 
 
 		 334 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5360  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.27 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624321  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0374  putative transcriptional regulator, ArsR family  27.3 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7771  putative transcriptional regulator, ArsR family  26.69 
 
 		 333 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5266  transcriptional regulator, ArsR family  21.91 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3521  ArsR family transcriptional regulator  21.91 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2987  transcriptional regulator, ArsR family  26.52 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375969  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6022  transcriptional regulator, ArsR family  23.55 
 
 		 319 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0416  putative transcriptional regulator, ArsR family  22.6 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3060  regulatory protein ArsR  28.48 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241489  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  43.86 
 
 		 120 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3377  transcriptional regulator, MarR family  25.54 
 
 		 328 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0559363  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 104 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 125 aa  43.9  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  44.12 
 
 		 119 aa  43.5  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>