57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0416 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0416  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 279 aa  558  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4515  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.31 
 
 		 326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.980218  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6022  transcriptional regulator, ArsR family  32.81 
 
 		 319 aa  108  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0374  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 		 325 aa  99.4  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02260  hypothetical protein  28.3 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8175  hypothetical protein  31.79 
 
 		 324 aa  92  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3806  transcriptional regulator, ArsR family  37.43 
 
 		 334 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7771  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 333 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3343  transcriptional regulator, ArsR family  29.41 
 
 		 325 aa  88.2  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20560  ArsR family regulatory protein  28.43 
 
 		 326 aa  88.2  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2987  transcriptional regulator, ArsR family  38.78 
 
 		 323 aa  82  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375969  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5309  transcriptional regulator, ArsR family  27.69 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5360  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.76 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624321  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7427  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.49 
 
 		 329 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01320  hypothetical protein  28.25 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7744  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.09 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8435  transcriptional regulator, MarR family  32.07 
 
 		 355 aa  75.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.927236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2607  putative transcriptional regulator, ArsR family  25.81 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334204  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6816  ArsR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 326 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5350  transcriptional regulator, ArsR family  33.68 
 
 		 299 aa  72  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.762712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8781  transcriptional regulator, ArsR family  32.51 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7857  regulatory protein ArsR  33.18 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1257  ArsR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0962048 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2939  hypothetical protein  29.89 
 
 		 348 aa  69.3  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188076  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5726  transcriptional regulator, MarR family  26.98 
 
 		 333 aa  68.9  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367585  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4678  ArsR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604348  normal  0.332683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5278  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.18 
 
 		 315 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101617 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2023  transcriptional regulator, ArsR family  29.74 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968345  normal  0.0622762 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1068  transcriptional regulator, ArsR family  36.43 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3060  regulatory protein ArsR  35.48 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241489  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8265  transcriptional regulator, ArsR family  22.6 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6759  normal  0.106103 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3074  transcriptional regulator, MarR family  29.02 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4248  regulatory protein, ArsR  30.41 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257853  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2604  regulatory protein ArsR  30 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000170459  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7936  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209211  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3377  transcriptional regulator, MarR family  28.33 
 
 		 328 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0559363  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0987  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 		 328 aa  50.4  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  47.92 
 
 		 116 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  50 
 
 		 121 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 122 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4187  transcriptional regulator, ArsR family  32.77 
 
 		 365 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal  0.285545 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  40.3 
 
 		 100 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3425  transcriptional regulator, ArsR family  33.82 
 
 		 115 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.461956  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  32.89 
 
 		 103 aa  43.5  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 		 114 aa  43.1  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  40.91 
 
 		 107 aa  43.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4648  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.09 
 
 		 359 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39269  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 		 114 aa  43.1  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 104 aa  43.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2970  ArsR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 110 aa  42.7  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3414  ArsR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 111 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 99 aa  42.4  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  51.22 
 
 		 142 aa  42.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5380  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 117 aa  42.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 112 aa  42.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 		 119 aa  42  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  51.22 
 
 		 142 aa  42.4  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>