75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2607 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2607  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 325 aa  644    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334204  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1257  ArsR family transcriptional regulator  64.78 
 
 		 320 aa  408  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0962048 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2939  hypothetical protein  40.38 
 
 		 348 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188076  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5278  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.77 
 
 		 315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101617 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2604  regulatory protein ArsR  41.05 
 
 		 328 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000170459  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7744  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.3 
 
 		 322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5726  transcriptional regulator, MarR family  43.57 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367585  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6816  ArsR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 326 aa  205  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8781  transcriptional regulator, ArsR family  40.5 
 
 		 329 aa  202  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8265  transcriptional regulator, ArsR family  38.34 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6759  normal  0.106103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8435  transcriptional regulator, MarR family  39.94 
 
 		 355 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.927236 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02260  hypothetical protein  40.26 
 
 		 315 aa  182  5.0000000000000004e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20560  ArsR family regulatory protein  36.08 
 
 		 326 aa  179  8e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7427  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.17 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1068  transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 		 329 aa  169  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5309  transcriptional regulator, ArsR family  35.99 
 
 		 318 aa  166  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3343  transcriptional regulator, ArsR family  35.62 
 
 		 325 aa  160  4e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01320  hypothetical protein  35.56 
 
 		 321 aa  152  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0987  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 		 328 aa  143  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5350  transcriptional regulator, ArsR family  37.13 
 
 		 299 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.762712  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3074  transcriptional regulator, MarR family  35.63 
 
 		 331 aa  142  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4248  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 329 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257853  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4678  ArsR family transcriptional regulator  36.34 
 
 		 329 aa  138  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604348  normal  0.332683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7936  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 328 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209211  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4515  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.13 
 
 		 326 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.980218  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8175  hypothetical protein  32.11 
 
 		 324 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4199  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.66 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000654261  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5360  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.33 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624321  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4137  transcriptional regulator, ArsR family  32.62 
 
 		 326 aa  99.8  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.121483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2023  transcriptional regulator, ArsR family  32.63 
 
 		 339 aa  99.8  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968345  normal  0.0622762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0374  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.6 
 
 		 325 aa  94  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3806  transcriptional regulator, ArsR family  32.91 
 
 		 334 aa  92.4  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7857  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 331 aa  90.5  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5266  transcriptional regulator, ArsR family  24.32 
 
 		 368 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7771  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.79 
 
 		 333 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3521  ArsR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 368 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0416  putative transcriptional regulator, ArsR family  27.42 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2987  transcriptional regulator, ArsR family  30.67 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375969  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3377  transcriptional regulator, MarR family  29.33 
 
 		 328 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0559363  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4648  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.41 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39269  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6022  transcriptional regulator, ArsR family  28.9 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3060  regulatory protein ArsR  28.14 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241489  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4187  transcriptional regulator, ArsR family  26.92 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal  0.285545 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1616  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.48 
 
 		 233 aa  49.7  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0967  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 181 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  38.57 
 
 		 123 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3321  transcriptional regulator, ArsR family  23.82 
 
 		 350 aa  47.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0720  regulatory protein ArsR  35.44 
 
 		 116 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.849038  normal  0.217468 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  44.78 
 
 		 109 aa  46.6  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0733  transcriptional regulator, ArsR family  38.03 
 
 		 106 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3425  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 		 115 aa  46.6  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.461956  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 437 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  45.45 
 
 		 114 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 104 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 103 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  43.94 
 
 		 115 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4238  ArsR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 358 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.499229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 104 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1116  ArsR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 117 aa  43.9  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3513  regulatory protein ArsR  40.58 
 
 		 109 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1560  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 		 180 aa  44.3  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.964745  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1865  transcriptional regulator, ArsR family  46.77 
 
 		 105 aa  43.9  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5737  ArsR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 108 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812377  normal  0.303432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0625  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 		 117 aa  43.5  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.906206 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5449  ArsR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 108 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3039  regulatory protein, ArsR  41.94 
 
 		 119 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 104 aa  43.5  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5359  ArsR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 108 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0251  transcriptional regulator, ArsR family  46.27 
 
 		 120 aa  43.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0712  ArsR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 121 aa  43.1  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 108 aa  43.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1346  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.85 
 
 		 107 aa  43.1  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.123906  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0248  regulatory protein ArsR  44.26 
 
 		 109 aa  42.7  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2227  transcriptional regulator, ArsR family  40.58 
 
 		 103 aa  42.7  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  40.28 
 
 		 108 aa  42.4  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>