157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1616 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1616  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
233 aa  481  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5271  transcriptional regulator, ArsR family  49.33 
 
 
227 aa  236  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1811  regulatory protein ArsR  48.89 
 
 
226 aa  228  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0305796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3092  transcriptional regulator, ArsR family  49.53 
 
 
235 aa  223  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.434868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2144  transcriptional regulator, ArsR family  49.06 
 
 
235 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3125  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 
234 aa  218  5e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000016515  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2887  ArsR family transcriptional regulator  46.43 
 
 
234 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000918682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2855  ArsR family transcriptional regulator  46.43 
 
 
234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000262914  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3107  transcriptional regulator, ArsR family  46.43 
 
 
234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3103  ArsR family transcriptional regulator  46.43 
 
 
234 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0102756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2816  ArsR family transcriptional regulator  45.98 
 
 
234 aa  210  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.1912  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2420  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.63 
 
 
226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.544065  normal  0.018861 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2796  transcriptional regulator, ArsR family  41.63 
 
 
226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2949  regulatory protein, ArsR  40.55 
 
 
224 aa  189  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.426987  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1071  transcriptional regulator ArsR family  40.27 
 
 
227 aa  186  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5019  ArsR family transcriptional regulator  44.5 
 
 
224 aa  186  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03630  ArsR family transcriptional regulator  42.08 
 
 
232 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00814661  hitchhiker  0.00000000608889 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3931  transcriptional regulator, ArsR family  42.22 
 
 
241 aa  178  8e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.280482 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3818  transcriptional regulator, ArsR family  42.22 
 
 
241 aa  178  8e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.389627 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0646  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.05 
 
 
228 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.646184  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0370  putative transcriptional regulator  42.08 
 
 
232 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1949  ArsR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
228 aa  175  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0701  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.7 
 
 
228 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.789639  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0920  ArsR family transcriptional regulator  44.3 
 
 
235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.670285  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4723  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
228 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1913  ArsR family transcriptional regulator  39.46 
 
 
221 aa  169  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0111474  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0386  ArsR family transcriptional regulator  40.09 
 
 
230 aa  169  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1841  ArsR family transcriptional regulator  38.77 
 
 
251 aa  169  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261316  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0205  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.25 
 
 
239 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4445  ArsR family transcriptional regulator  40.27 
 
 
229 aa  169  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2096  ArsR family transcriptional regulator  39.32 
 
 
255 aa  167  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264714  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4261  ArsR family transcriptional regulator  38.87 
 
 
251 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2320  transcriptional regulator, ArsR family  41.7 
 
 
223 aa  166  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307991  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4180  transcriptional regulator, ArsR family  40.44 
 
 
230 aa  166  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0708963  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0204  regulatory protein, ArsR  39.02 
 
 
251 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.871171  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1308  ArsR family transcriptional regulator  40.09 
 
 
244 aa  166  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0278  transcriptional regulator, MarR family  40.54 
 
 
251 aa  164  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2819  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
245 aa  162  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  decreased coverage  0.0000226835 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3068  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.23 
 
 
237 aa  161  6e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0540  regulatory protein ArsR  40.44 
 
 
227 aa  159  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.60419  normal  0.57949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5959  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.4 
 
 
253 aa  158  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1990  regulatory protein ArsR  41.15 
 
 
229 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.126162  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5197  ArsR family transcriptional regulator  40.37 
 
 
229 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.539202  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2216  ArsR family transcriptional regulator  37.78 
 
 
251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.779866  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5569  ArsR family transcriptional regulator  40.55 
 
 
235 aa  155  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4600  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.22 
 
 
248 aa  155  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.964571  hitchhiker  0.00711376 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6202  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.86 
 
 
277 aa  155  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0373742  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2855  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
265 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.832664  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0967  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
235 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1988  transcriptional regulator, ArsR family  39.07 
 
 
235 aa  152  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.433498  hitchhiker  0.000545084 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2022  transcriptional regulator, ArsR family  42.38 
 
 
224 aa  152  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2344  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 
239 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0963  ArsR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
235 aa  151  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699714  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1571  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 
233 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.346453  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1415  transcriptional regulator, ArsR family  35.68 
 
 
234 aa  149  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.449708  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4201  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 
235 aa  148  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17630  predicted transcriptional regulator  37.33 
 
 
225 aa  146  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00761162  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0490  ArsR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2943  ArsR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00832197  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4959  transcriptional regulator, ArsR family  35.84 
 
 
236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2519  ArsR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0893  ArsR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0509477  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2830  ArsR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.509884  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2892  ArsR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0255  ArsR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.741592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4486  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.07 
 
 
242 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000320614  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1046  ArsR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
235 aa  141  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418745  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4373  transcriptional regulator, ArsR family  35.24 
 
 
238 aa  141  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.302394 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4263  transcriptional regulator, ArsR family  35.24 
 
 
238 aa  141  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.277742 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2952  transcriptional regulator, ArsR family  35.27 
 
 
239 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.993569  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4624  ArsR family transcriptional regulator  37.05 
 
 
240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3471  ArsR family transcriptional regulator  38.12 
 
 
253 aa  139  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114608  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0608  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 
235 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1087  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 
235 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0409  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.67 
 
 
228 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2507  transcriptional regulator, ArsR family  34.05 
 
 
245 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0790  ArsR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
238 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0653543 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2808  ArsR family transcriptional regulator  36.12 
 
 
232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1033  ArsR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0926  ArsR family transcriptional regulator  32.42 
 
 
228 aa  135  4e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.18916  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3452  ArsR family transcriptional regulator  33.92 
 
 
234 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1682  ArsR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
290 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0669  ArsR family transcriptional regulator  31.74 
 
 
244 aa  132  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0660  regulatory protein, ArsR  30.09 
 
 
230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0756  transcriptional regulator, putative  31.94 
 
 
230 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3526  ArsR family transcriptional regulator  48.96 
 
 
101 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4573  ArsR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
235 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000870206  normal  0.0122387 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0635  ArsR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
237 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138401 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0630  regulatory protein, ArsR  28.7 
 
 
237 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000903473  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0590  ArsR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
237 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130904  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0500  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
84 aa  63.9  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.372898 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8471  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 
130 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
109 aa  51.6  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
122 aa  50.8  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
437 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3937  regulatory protein, ArsR  37.08 
 
 
109 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  31.65 
 
 
121 aa  48.1  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  31.87 
 
 
125 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0894  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 
141 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
125 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>