196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4180 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4180  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 230 aa  441  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0708963  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4445  ArsR family transcriptional regulator  79.57 
 
 		 229 aa  330  8e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1071  transcriptional regulator ArsR family  56.44 
 
 		 227 aa  225  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2096  ArsR family transcriptional regulator  58.44 
 
 		 255 aa  223  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2855  ArsR family transcriptional regulator  52.56 
 
 		 265 aa  206  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.832664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0646  putative transcriptional regulator, ArsR family  51.53 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.646184  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0701  putative transcriptional regulator, ArsR family  51.53 
 
 		 228 aa  204  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.789639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2344  transcriptional regulator, ArsR family  51.71 
 
 		 239 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1913  ArsR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 221 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0111474  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0540  regulatory protein ArsR  50.9 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.60419  normal  0.57949 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1841  ArsR family transcriptional regulator  48.2 
 
 		 251 aa  192  4e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261316  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1990  regulatory protein ArsR  50 
 
 		 229 aa  189  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.126162  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0386  ArsR family transcriptional regulator  46.02 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2420  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.81 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.544065  normal  0.018861 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2796  transcriptional regulator, ArsR family  47.81 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0204  regulatory protein, ArsR  45.11 
 
 		 251 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.871171  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4261  ArsR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 251 aa  178  7e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0205  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.74 
 
 		 239 aa  177  9e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5271  transcriptional regulator, ArsR family  36.28 
 
 		 227 aa  175  6e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1616  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.44 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4723  ArsR family transcriptional regulator  40.81 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2949  regulatory protein, ArsR  37.55 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.426987  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1571  transcriptional regulator, ArsR family  44.39 
 
 		 233 aa  171  5.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.346453  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5959  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.4 
 
 		 253 aa  169  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4959  transcriptional regulator, ArsR family  48.18 
 
 		 236 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1811  regulatory protein ArsR  36.56 
 
 		 226 aa  162  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0305796  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2144  transcriptional regulator, ArsR family  38.07 
 
 		 235 aa  161  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5019  ArsR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4263  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 238 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.277742 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4373  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 238 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.302394 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1415  transcriptional regulator, ArsR family  43.91 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.449708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3125  transcriptional regulator, ArsR family  36.61 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000016515  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1949  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 228 aa  159  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4600  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.29 
 
 		 248 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.964571  hitchhiker  0.00711376 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3092  transcriptional regulator, ArsR family  37.61 
 
 		 235 aa  158  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.434868  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2887  ArsR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000918682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2855  ArsR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000262914  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2816  ArsR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.1912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3103  ArsR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0102756  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3107  transcriptional regulator, ArsR family  35.65 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2952  transcriptional regulator, ArsR family  45.91 
 
 		 239 aa  155  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.993569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17630  predicted transcriptional regulator  44.44 
 
 		 225 aa  155  7e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00761162  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2320  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1033  ArsR family transcriptional regulator  45.91 
 
 		 237 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4486  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.06 
 
 		 242 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000320614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0920  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.670285  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3818  transcriptional regulator, ArsR family  41.45 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.389627 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3931  transcriptional regulator, ArsR family  41.45 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.280482 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2808  ArsR family transcriptional regulator  45.09 
 
 		 232 aa  148  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2216  ArsR family transcriptional regulator  46.82 
 
 		 251 aa  148  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.779866  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1988  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 235 aa  147  9e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.433498  hitchhiker  0.000545084 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6202  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.57 
 
 		 277 aa  146  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0373742  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2943  ArsR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00832197  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3471  ArsR family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114608  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0790  ArsR family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0653543 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2830  ArsR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.509884  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0490  ArsR family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 236 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0967  ArsR family transcriptional regulator  47.09 
 
 		 235 aa  142  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2519  ArsR family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 236 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0893  ArsR family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 236 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0509477  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2892  ArsR family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 236 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0255  ArsR family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 236 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.741592  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5197  ArsR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 229 aa  142  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.539202  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0963  ArsR family transcriptional regulator  47.09 
 
 		 235 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03630  ArsR family transcriptional regulator  42.04 
 
 		 232 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00814661  hitchhiker  0.00000000608889 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0370  putative transcriptional regulator  42.92 
 
 		 232 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4201  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 235 aa  141  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2819  ArsR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 245 aa  140  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  decreased coverage  0.0000226835 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3068  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.49 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3452  ArsR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5569  ArsR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 235 aa  138  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4624  ArsR family transcriptional regulator  42.92 
 
 		 240 aa  137  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0608  ArsR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1087  ArsR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1046  ArsR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 235 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2022  transcriptional regulator, ArsR family  46.51 
 
 		 224 aa  135  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0926  ArsR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 228 aa  135  7.000000000000001e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.18916  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0278  transcriptional regulator, MarR family  39.82 
 
 		 251 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0669  ArsR family transcriptional regulator  38.77 
 
 		 244 aa  132  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1308  ArsR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 244 aa  133  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1682  ArsR family transcriptional regulator  43.44 
 
 		 290 aa  128  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4573  ArsR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 235 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000870206  normal  0.0122387 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0409  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.07 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2507  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0660  regulatory protein, ArsR  37.05 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0635  ArsR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 237 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138401 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0590  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 237 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0630  regulatory protein, ArsR  35.78 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000903473  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0756  transcriptional regulator, putative  36.61 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0500  ArsR family transcriptional regulator  55.41 
 
 		 84 aa  77.4  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.372898 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3526  ArsR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 101 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0327  regulatory protein ArsR  38.75 
 
 		 165 aa  54.7  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.395704  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1516  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 		 399 aa  53.1  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07760  predicted transcriptional regulator  34.52 
 
 		 120 aa  52.4  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.853788  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1439  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 125 aa  52  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  37.8 
 
 		 270 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3937  regulatory protein, ArsR  34.48 
 
 		 109 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2472  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 119 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 		 103 aa  49.3  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>