99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1415 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1415  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
234 aa  470  1.0000000000000001e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.449708  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4445  ArsR family transcriptional regulator  45.06 
 
 
229 aa  159  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4261  ArsR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
251 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0205  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.68 
 
 
239 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0646  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.59 
 
 
228 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.646184  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0204  regulatory protein, ArsR  39.83 
 
 
251 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.871171  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1913  ArsR family transcriptional regulator  42.61 
 
 
221 aa  154  9e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0111474  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1841  ArsR family transcriptional regulator  42.61 
 
 
251 aa  154  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261316  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2344  transcriptional regulator, ArsR family  46.44 
 
 
239 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2855  ArsR family transcriptional regulator  46.19 
 
 
265 aa  152  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.832664  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0540  regulatory protein ArsR  41.99 
 
 
227 aa  152  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.60419  normal  0.57949 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1071  transcriptional regulator ArsR family  42.67 
 
 
227 aa  152  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0701  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.71 
 
 
228 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.789639  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4180  transcriptional regulator, ArsR family  43.91 
 
 
230 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0708963  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1990  regulatory protein ArsR  45.61 
 
 
229 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.126162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5271  transcriptional regulator, ArsR family  33.78 
 
 
227 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1616  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.68 
 
 
233 aa  149  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2949  regulatory protein, ArsR  32.29 
 
 
224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.426987  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1571  transcriptional regulator, ArsR family  40.35 
 
 
233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.346453  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2096  ArsR family transcriptional regulator  44.02 
 
 
255 aa  145  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264714  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4723  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
228 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1949  ArsR family transcriptional regulator  39.91 
 
 
228 aa  143  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2796  transcriptional regulator, ArsR family  39.65 
 
 
226 aa  141  9e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2420  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.65 
 
 
226 aa  141  9e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.544065  normal  0.018861 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1811  regulatory protein ArsR  33.19 
 
 
226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0305796  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5959  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.17 
 
 
253 aa  138  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6202  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 
277 aa  138  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0373742  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5019  ArsR family transcriptional regulator  40.36 
 
 
224 aa  135  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3107  transcriptional regulator, ArsR family  34.72 
 
 
234 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2855  ArsR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
234 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000262914  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3103  ArsR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
234 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0102756  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2887  ArsR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
234 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000918682  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2816  ArsR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
234 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.1912  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0386  ArsR family transcriptional regulator  38.22 
 
 
230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3452  ArsR family transcriptional regulator  40.27 
 
 
234 aa  133  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4600  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.08 
 
 
248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.964571  hitchhiker  0.00711376 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2022  transcriptional regulator, ArsR family  45.89 
 
 
224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3125  transcriptional regulator, ArsR family  33.8 
 
 
234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000016515  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0278  transcriptional regulator, MarR family  36.56 
 
 
251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2216  ArsR family transcriptional regulator  43.17 
 
 
251 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.779866  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3092  transcriptional regulator, ArsR family  33.8 
 
 
235 aa  128  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.434868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2144  transcriptional regulator, ArsR family  33.8 
 
 
235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2819  ArsR family transcriptional regulator  39.21 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  decreased coverage  0.0000226835 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4201  ArsR family transcriptional regulator  42.29 
 
 
235 aa  126  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0963  ArsR family transcriptional regulator  43.97 
 
 
235 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699714  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0967  ArsR family transcriptional regulator  43.97 
 
 
235 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2830  ArsR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
236 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.509884  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2943  ArsR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
236 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00832197  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0255  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
236 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.741592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2892  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
236 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0893  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
236 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0509477  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2519  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
236 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0490  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
236 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17630  predicted transcriptional regulator  35.81 
 
 
225 aa  124  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00761162  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3931  transcriptional regulator, ArsR family  36.48 
 
 
241 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.280482 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3818  transcriptional regulator, ArsR family  36.48 
 
 
241 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.389627 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0920  ArsR family transcriptional regulator  42.53 
 
 
235 aa  122  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.670285  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4624  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
240 aa  122  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1046  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 
235 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418745  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0608  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 
235 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1087  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 
235 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03630  ArsR family transcriptional regulator  39.46 
 
 
232 aa  121  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00814661  hitchhiker  0.00000000608889 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1988  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 
235 aa  121  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.433498  hitchhiker  0.000545084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2320  transcriptional regulator, ArsR family  41.15 
 
 
223 aa  120  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307991  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3068  putative transcriptional regulator, ArsR family  27.91 
 
 
237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4959  transcriptional regulator, ArsR family  38.84 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1033  ArsR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
237 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2952  transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 
239 aa  118  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.993569  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4486  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 
242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000320614  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0790  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
238 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0653543 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2808  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
232 aa  115  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3471  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
253 aa  115  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114608  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4263  transcriptional regulator, ArsR family  39.91 
 
 
238 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.277742 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4373  transcriptional regulator, ArsR family  39.91 
 
 
238 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.302394 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0370  putative transcriptional regulator  37.67 
 
 
232 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5197  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
229 aa  111  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.539202  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0669  ArsR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0926  ArsR family transcriptional regulator  31.39 
 
 
228 aa  109  5e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.18916  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5569  ArsR family transcriptional regulator  37.56 
 
 
235 aa  105  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1308  ArsR family transcriptional regulator  38.53 
 
 
244 aa  105  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0409  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.51 
 
 
228 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1682  ArsR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
290 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2507  transcriptional regulator, ArsR family  35.59 
 
 
245 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4573  ArsR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
235 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000870206  normal  0.0122387 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0635  ArsR family transcriptional regulator  32.24 
 
 
237 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138401 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0660  regulatory protein, ArsR  33.63 
 
 
230 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0590  ArsR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
237 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130904  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0630  regulatory protein, ArsR  31.8 
 
 
237 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000903473  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0756  transcriptional regulator, putative  33.04 
 
 
230 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0500  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
84 aa  77.8  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.372898 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3526  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
101 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3937  regulatory protein, ArsR  37.25 
 
 
109 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
115 aa  47  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5082  transcriptional regulator, ArsR family  40.23 
 
 
107 aa  42.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.657053 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1172  transcriptional regulator, ArsR family  29.45 
 
 
232 aa  42.7  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
125 aa  42.4  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6346  transcriptional regulator, ArsR family  27.63 
 
 
89 aa  42.4  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3902  regulatory protein, ArsR  37.08 
 
 
109 aa  42  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20650  transcriptional regulator, ArsR family  33.01 
 
 
119 aa  41.6  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>