136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4959 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4959  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 236 aa  468  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1949  ArsR family transcriptional regulator  57.4 
 
 		 228 aa  240  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3471  ArsR family transcriptional regulator  60.27 
 
 		 253 aa  239  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114608  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4373  transcriptional regulator, ArsR family  46.72 
 
 		 238 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.302394 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4263  transcriptional regulator, ArsR family  46.72 
 
 		 238 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.277742 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4723  ArsR family transcriptional regulator  44.02 
 
 		 228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1571  transcriptional regulator, ArsR family  44.34 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.346453  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2943  ArsR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 236 aa  175  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00832197  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2830  ArsR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 236 aa  175  7e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.509884  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0490  ArsR family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2519  ArsR family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0893  ArsR family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0509477  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2892  ArsR family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0255  ArsR family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.741592  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5569  ArsR family transcriptional regulator  45.09 
 
 		 235 aa  166  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5197  ArsR family transcriptional regulator  47.03 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.539202  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2216  ArsR family transcriptional regulator  49.54 
 
 		 251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.779866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3092  transcriptional regulator, ArsR family  40.93 
 
 		 235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.434868  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03630  ArsR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00814661  hitchhiker  0.00000000608889 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4445  ArsR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0646  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.89 
 
 		 228 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.646184  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1071  transcriptional regulator ArsR family  46.73 
 
 		 227 aa  161  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2144  transcriptional regulator, ArsR family  40.47 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0370  putative transcriptional regulator  46.7 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2816  ArsR family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 234 aa  158  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.1912  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4180  transcriptional regulator, ArsR family  48.18 
 
 		 230 aa  158  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0708963  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0701  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.99 
 
 		 228 aa  158  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.789639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3931  transcriptional regulator, ArsR family  42.79 
 
 		 241 aa  157  9e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.280482 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3818  transcriptional regulator, ArsR family  42.79 
 
 		 241 aa  157  9e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.389627 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0540  regulatory protein ArsR  43.84 
 
 		 227 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.60419  normal  0.57949 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3125  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000016515  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1033  ArsR family transcriptional regulator  46.64 
 
 		 237 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2952  transcriptional regulator, ArsR family  46.19 
 
 		 239 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.993569  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2887  ArsR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 234 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000918682  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3103  ArsR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 234 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0102756  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2855  ArsR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 234 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000262914  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3107  transcriptional regulator, ArsR family  38.53 
 
 		 234 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4201  ArsR family transcriptional regulator  49.77 
 
 		 235 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1811  regulatory protein ArsR  36.49 
 
 		 226 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0305796  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5271  transcriptional regulator, ArsR family  35.41 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1913  ArsR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0111474  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0967  ArsR family transcriptional regulator  49.29 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1682  ArsR family transcriptional regulator  46.4 
 
 		 290 aa  149  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4261  ArsR family transcriptional regulator  39.75 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0963  ArsR family transcriptional regulator  49.29 
 
 		 235 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699714  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0204  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 251 aa  148  6e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.871171  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1841  ArsR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 251 aa  148  7e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261316  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1308  ArsR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0205  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.61 
 
 		 239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0790  ArsR family transcriptional regulator  44.54 
 
 		 238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0653543 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1616  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.84 
 
 		 233 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2420  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.11 
 
 		 226 aa  145  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.544065  normal  0.018861 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2796  transcriptional regulator, ArsR family  39.11 
 
 		 226 aa  145  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2808  ArsR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 232 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0608  ArsR family transcriptional regulator  49.31 
 
 		 235 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1087  ArsR family transcriptional regulator  49.31 
 
 		 235 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2949  regulatory protein, ArsR  31.8 
 
 		 224 aa  145  8.000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.426987  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1046  ArsR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 235 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0669  ArsR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 244 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0386  ArsR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 230 aa  143  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3068  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.73 
 
 		 237 aa  142  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2096  ArsR family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 255 aa  142  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1990  regulatory protein ArsR  42.92 
 
 		 229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.126162  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5959  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2320  transcriptional regulator, ArsR family  45 
 
 		 223 aa  132  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2819  ArsR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 245 aa  130  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  decreased coverage  0.0000226835 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2855  ArsR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.832664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4573  ArsR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000870206  normal  0.0122387 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2344  transcriptional regulator, ArsR family  43.52 
 
 		 239 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0660  regulatory protein, ArsR  38.22 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6202  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.5 
 
 		 277 aa  125  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0373742  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17630  predicted transcriptional regulator  38.57 
 
 		 225 aa  121  8e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00761162  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4486  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 		 242 aa  121  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000320614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0278  transcriptional regulator, MarR family  36.82 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0635  ArsR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138401 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1415  transcriptional regulator, ArsR family  38.84 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.449708  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0590  ArsR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 237 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0630  regulatory protein, ArsR  37.44 
 
 		 237 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000903473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0920  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 235 aa  115  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.670285  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4600  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.66 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.964571  hitchhiker  0.00711376 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5019  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 224 aa  115  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0756  transcriptional regulator, putative  39.56 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2022  transcriptional regulator, ArsR family  43.81 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1988  transcriptional regulator, ArsR family  39.07 
 
 		 235 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.433498  hitchhiker  0.000545084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0409  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 		 228 aa  113  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0926  ArsR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 228 aa  113  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.18916  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3452  ArsR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4624  ArsR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2507  transcriptional regulator, ArsR family  37.16 
 
 		 245 aa  99.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0500  ArsR family transcriptional regulator  56.76 
 
 		 84 aa  84  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.372898 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3526  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2180  ArsR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3427  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.299912  normal  0.0245638 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4688  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 		 95 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000941473  hitchhiker  1.78464e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0649  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 		 95 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0578  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 95 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000313265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0522  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 95 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.61865e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0522  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 95 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000193474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0612  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 95 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000261335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>