117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4573 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4573  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000870206  normal  0.0122387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0630  regulatory protein, ArsR  81.43 
 
 		 237 aa  357  9e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000903473  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0590  ArsR family transcriptional regulator  81.43 
 
 		 237 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0635  ArsR family transcriptional regulator  81.01 
 
 		 237 aa  354  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138401 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0660  regulatory protein, ArsR  56.19 
 
 		 230 aa  231  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0669  ArsR family transcriptional regulator  53.16 
 
 		 244 aa  228  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0756  transcriptional regulator, putative  56.64 
 
 		 230 aa  215  5e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5197  ArsR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.539202  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5569  ArsR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03630  ArsR family transcriptional regulator  47.09 
 
 		 232 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00814661  hitchhiker  0.00000000608889 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0370  putative transcriptional regulator  46.19 
 
 		 232 aa  167  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0490  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2519  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0893  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0509477  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2892  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0255  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.741592  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2943  ArsR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 236 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00832197  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2830  ArsR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 236 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.509884  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1033  ArsR family transcriptional regulator  43.11 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2952  transcriptional regulator, ArsR family  42.54 
 
 		 239 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.993569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2216  ArsR family transcriptional regulator  40.81 
 
 		 251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.779866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0790  ArsR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 238 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0653543 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1682  ArsR family transcriptional regulator  43.95 
 
 		 290 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0967  ArsR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 235 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4959  transcriptional regulator, ArsR family  39.81 
 
 		 236 aa  139  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0963  ArsR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699714  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4201  ArsR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 235 aa  135  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0608  ArsR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 235 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1087  ArsR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 235 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1841  ArsR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 251 aa  134  9e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261316  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3471  ArsR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 253 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114608  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1046  ArsR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 235 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4180  transcriptional regulator, ArsR family  37.39 
 
 		 230 aa  133  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0708963  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1913  ArsR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0111474  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4445  ArsR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2949  regulatory protein, ArsR  31.16 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.426987  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2420  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.99 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.544065  normal  0.018861 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2796  transcriptional regulator, ArsR family  36.99 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1949  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 		 228 aa  126  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3092  transcriptional regulator, ArsR family  32.3 
 
 		 235 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.434868  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0701  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.82 
 
 		 228 aa  124  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.789639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0540  regulatory protein ArsR  35 
 
 		 227 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.60419  normal  0.57949 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2144  transcriptional regulator, ArsR family  30.8 
 
 		 235 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3125  transcriptional regulator, ArsR family  30.8 
 
 		 234 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000016515  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0646  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.48 
 
 		 228 aa  121  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.646184  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2816  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 234 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.1912  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2887  ArsR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000918682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2855  ArsR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000262914  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3103  ArsR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0102756  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3107  transcriptional regulator, ArsR family  30.8 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4723  ArsR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3818  transcriptional regulator, ArsR family  34.07 
 
 		 241 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.389627 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1071  transcriptional regulator ArsR family  35.02 
 
 		 227 aa  116  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3931  transcriptional regulator, ArsR family  34.07 
 
 		 241 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.280482 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1571  transcriptional regulator, ArsR family  32.86 
 
 		 233 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.346453  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0386  ArsR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1811  regulatory protein ArsR  30.18 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0305796  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2808  ArsR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1616  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.97 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2344  transcriptional regulator, ArsR family  33.76 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5271  transcriptional regulator, ArsR family  27.47 
 
 		 227 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2855  ArsR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.832664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1990  regulatory protein ArsR  38.12 
 
 		 229 aa  108  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.126162  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4263  transcriptional regulator, ArsR family  33.19 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.277742 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4373  transcriptional regulator, ArsR family  33.19 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.302394 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0205  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.51 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4261  ArsR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0204  regulatory protein, ArsR  32.5 
 
 		 251 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.871171  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2096  ArsR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 255 aa  101  9e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1415  transcriptional regulator, ArsR family  32.47 
 
 		 234 aa  99.8  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.449708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2507  transcriptional regulator, ArsR family  31.65 
 
 		 245 aa  99.4  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3068  putative transcriptional regulator, ArsR family  25.79 
 
 		 237 aa  99.8  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5019  ArsR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 224 aa  99.4  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2320  transcriptional regulator, ArsR family  32.59 
 
 		 223 aa  97.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5959  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.97 
 
 		 253 aa  95.9  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1308  ArsR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 244 aa  94.4  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2022  transcriptional regulator, ArsR family  32.14 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2819  ArsR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 245 aa  93.2  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  decreased coverage  0.0000226835 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0278  transcriptional regulator, MarR family  29.86 
 
 		 251 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0409  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.38 
 
 		 228 aa  90.9  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6202  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.12 
 
 		 277 aa  90.9  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0373742  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4600  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.4 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.964571  hitchhiker  0.00711376 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0920  ArsR family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 235 aa  90.9  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.670285  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3452  ArsR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 234 aa  89.4  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1988  transcriptional regulator, ArsR family  32.42 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.433498  hitchhiker  0.000545084 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4624  ArsR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4486  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.26 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000320614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0926  ArsR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.18916  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17630  predicted transcriptional regulator  30.53 
 
 		 225 aa  71.6  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00761162  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  37.23 
 
 		 119 aa  52.4  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3526  ArsR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 101 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0500  ArsR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 84 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.372898 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 119 aa  49.3  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 115 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12026  transcriptional regulator  35.56 
 
 		 118 aa  47  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  33.01 
 
 		 124 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  33 
 
 		 112 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20650  transcriptional regulator, ArsR family  34.04 
 
 		 119 aa  46.6  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1439  transcriptional regulator, ArsR family  32.53 
 
 		 125 aa  47  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>