More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8471 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8471  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 130 aa  256  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  51.58 
 
 		 125 aa  97.4  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1714  transcriptional regulator, ArsR family  52.69 
 
 		 119 aa  94.7  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388978  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3827  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 125 aa  94.4  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36710  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.944272 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3138  regulatory protein ArsR  47.47 
 
 		 127 aa  87.8  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4286  transcriptional regulator, ArsR family  50.52 
 
 		 118 aa  86.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.30031  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4262  ArsR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.264931  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2721  regulatory protein ArsR  43.16 
 
 		 132 aa  83.6  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10842  transcriptional regulator  42.99 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.67021e-19  hitchhiker  0.000000379454 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3728  regulatory protein, ArsR  45.78 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  45.98 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3727  regulatory protein, ArsR  39.6 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1901  regulatory protein, ArsR  42.57 
 
 		 141 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3224  regulatory protein, ArsR  40.59 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.930108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5816  transcriptional regulator, ArsR family  40.95 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1486  ArsR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1488  ArsR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1510  ArsR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09790  predicted transcriptional regulator  43.48 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829992  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2354  transcriptional regulator, ArsR family  47.25 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000229656  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0894  transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  43.21 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2476  ArsR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07760  predicted transcriptional regulator  37.93 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.853788  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2803  ArsR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 216 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  28.72 
 
 		 123 aa  60.1  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  31.53 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2584  ArsR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  33.65 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1459  ArsR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1470  transcriptional regulator, ArsR family  32.38 
 
 		 119 aa  57  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967801  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 		 124 aa  57  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  27.96 
 
 		 102 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5019  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 224 aa  57  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4462  transcriptional regulator, ArsR family  34.21 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  33.9 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2309  regulatory protein ArsR  34.38 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.374797 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3259  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0701  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.59 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.789639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0646  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.59 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.646184  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  31.82 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0370  putative transcriptional regulator  42.67 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0100  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1580  regulatory protein ArsR  36.96 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0014541  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03630  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00814661  hitchhiker  0.00000000608889 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  31.18 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0020  regulatory protein, ArsR  38.96 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0540  regulatory protein ArsR  43.04 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.60419  normal  0.57949 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1589  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000194684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0669  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 244 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1532  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  34.94 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  37.18 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3285  transcriptional regulator ArsR family  34.07 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 101 aa  53.5  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  38.27 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  35.9 
 
 		 102 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1821  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.321191  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  33.75 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00003097  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 		 135 aa  52.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2819  ArsR family transcriptional regulator  48.86 
 
 		 245 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  decreased coverage  0.0000226835 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  32.43 
 
 		 93 aa  52.8  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 102 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0023  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124872  hitchhiker  0.000733869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000364753  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  26.36 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  40.79 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 		 102 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  26.36 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 102 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  35.9 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3726  ArsR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 227 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 437 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  35.9 
 
 		 102 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3818  transcriptional regulator, ArsR family  41.11 
 
 		 241 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.389627 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1168  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315565  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1616  putative transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 		 233 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3931  transcriptional regulator, ArsR family  41.11 
 
 		 241 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.280482 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1854  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1541  ArsR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 123 aa  51.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0806106  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1990  regulatory protein ArsR  40.22 
 
 		 229 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.126162  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0132  transcriptional regulator, TrmB  44.71 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0240  ArsR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 227 aa  51.2  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1033  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 237 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4283  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302443  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 101 aa  51.6  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5180  transcriptional regulator, ArsR family  33.64 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  28.89 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  41.89 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>