277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5180 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5180  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 113 aa  225  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4059  regulatory protein, ArsR  44.05 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.507544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03940  transcriptional regulator, ArsR family  43.18 
 
 		 98 aa  75.1  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.621476  normal  0.0987714 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2062  ArsR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.242619  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2108  ArsR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.777393  normal  0.0654079 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2045  ArsR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04390  predicted transcriptional regulator  45.65 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2283  regulatory protein, ArsR  44.05 
 
 		 129 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165563 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1926  regulatory protein ArsR  43.68 
 
 		 99 aa  68.6  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1972  transcriptional regulator, ArsR family  44.32 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.845945  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3539  MarR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.107907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  35.29 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  35.16 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  35.58 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  28.43 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  31.73 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0205  ArsR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 		 100 aa  57  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2654  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 109 aa  57  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1168  transcriptional regulator, ArsR family  37.63 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315565  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2559  transcriptional regulator, ArsR family  35.96 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103934  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  34.44 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  36.05 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  34.12 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4158  ArsR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000881088  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  32.95 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  34.12 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4504  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279402 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4447  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4509  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4321  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4169  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.559652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4655  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.337504  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  32.56 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  30.68 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0451  transcriptional regulator, ArsR family  35.05 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0116  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  30.95 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  33.75 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  31.76 
 
 		 120 aa  53.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  29.67 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1382  ArsR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  29.89 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.08 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1937  ArsR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  29.55 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1719  transcriptional regulator, ArsR family  33.78 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  32.91 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1137  transcriptional regulator, ArsR family  33.78 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0548  transcriptional regulator, ArsR family  33.78 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8471  transcriptional regulator, ArsR family  33.64 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 		 125 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 		 125 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1508  regulatory protein ArsR  35.14 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.531192 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  41.18 
 
 		 125 aa  50.8  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 125 aa  50.4  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0886  transcriptional regulator, ArsR family  39.71 
 
 		 129 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0860  transcriptional regulator, ArsR family  39.71 
 
 		 129 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09790  predicted transcriptional regulator  37.5 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829992  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1126  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 131 aa  50.4  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0458599  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  32.56 
 
 		 122 aa  50.1  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  28.28 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2544  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1258  cadmium efflux system accessory protein  30 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3909  transcriptional regulator, ArsR family  27.27 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.305368 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  30.77 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  37.35 
 
 		 118 aa  49.7  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  36.84 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  37.97 
 
 		 270 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1755  transcriptional regulator CzrA  33.72 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.952937  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1516  transcriptional regulator, ArsR family  32.56 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000659197  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  32.91 
 
 		 125 aa  48.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02523  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.27 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1016  transcriptional regulator, ArsR family  27.27 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1039  ArsR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02487  hypothetical protein  27.27 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 173 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1821  transcriptional regulator, ArsR family  31.46 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.321191  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  33.73 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2802  ArsR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2947  ArsR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>