283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3539 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3539  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 146 aa  291  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.107907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2283  regulatory protein, ArsR  45.95 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165563 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2062  ArsR family transcriptional regulator  52.22 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.242619  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2108  ArsR family transcriptional regulator  52.22 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.777393  normal  0.0654079 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2045  ArsR family transcriptional regulator  52.22 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4059  regulatory protein, ArsR  49.47 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.507544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1926  regulatory protein ArsR  45.68 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03940  transcriptional regulator, ArsR family  46.34 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.621476  normal  0.0987714 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1972  transcriptional regulator, ArsR family  44.58 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.845945  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  45.35 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5180  transcriptional regulator, ArsR family  47.5 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4447  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  43.02 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4451  ArsR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  38.37 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09790  predicted transcriptional regulator  45.12 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829992  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  38.16 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0100  ArsR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  37.23 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  36.84 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  28.33 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  39.76 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  39.02 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0451  transcriptional regulator, ArsR family  41.77 
 
 		 115 aa  57  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  36.05 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  31.73 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  37.23 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04390  predicted transcriptional regulator  35.58 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2654  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2559  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103934  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0439  transcriptional regulator  38.55 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000113831  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  32.56 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  32.58 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  41.76 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  41.76 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4146  regulatory protein, ArsR  44.59 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  26.05 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  32.14 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1126  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0458599  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  31.9 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 		 122 aa  52.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  34.15 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  34.62 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  34.62 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  29.07 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  37.35 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1854  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  30.86 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0187  transcriptional regulator, ArsR family  37.23 
 
 		 127 aa  51.6  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6188  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  35.8 
 
 		 118 aa  51.6  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 115 aa  50.8  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  34.04 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1839  transcriptional regulator, ArsR family  33.77 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000260966  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  33.72 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  41.89 
 
 		 118 aa  50.4  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 		 122 aa  50.4  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2544  transcriptional regulator, ArsR family  34.83 
 
 		 130 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  36.63 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0886  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0894  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3674  ArsR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0860  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4227  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4462  transcriptional regulator, ArsR family  35.96 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  35.62 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3922  hypothetical protein  46.97 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.63414  normal  0.473928 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0341  ArsR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000827961  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  47.06 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  29.89 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4283  transcriptional regulator, ArsR family  44.05 
 
 		 124 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302443  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 297 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0426  ArsR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.850787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  37.04 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1908  regulatory protein ArsR  40.74 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>