243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1926 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1926  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 99 aa  196  6e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2062  ArsR family transcriptional regulator  75.28 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.242619  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2108  ArsR family transcriptional regulator  75.28 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.777393  normal  0.0654079 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2045  ArsR family transcriptional regulator  75.28 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2283  regulatory protein, ArsR  71.91 
 
 		 129 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4059  regulatory protein, ArsR  71.91 
 
 		 114 aa  138  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.507544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03940  transcriptional regulator, ArsR family  54.76 
 
 		 98 aa  91.7  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.621476  normal  0.0987714 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1972  transcriptional regulator, ArsR family  48.89 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.845945  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04390  predicted transcriptional regulator  45.98 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3539  MarR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.107907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5180  transcriptional regulator, ArsR family  43.68 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4451  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  39.08 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2654  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  49.32 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.58 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  43.9 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4447  ArsR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  35.37 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4462  transcriptional regulator, ArsR family  45.31 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2928  transcriptional regulator, TrmB  35.71 
 
 		 130 aa  52.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  38.75 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 173 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  32.18 
 
 		 119 aa  50.4  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 129 aa  50.4  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1041  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2544  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 		 130 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  36.08 
 
 		 118 aa  50.1  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  35.96 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  39.74 
 
 		 287 aa  49.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1075  regulatory protein, ArsR  37.14 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122284  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2480  transcriptional regulator, ArsR family  35.96 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0100  ArsR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  38.36 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2859  transcriptional regulator, ArsR  35.96 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.156895  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  35 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  41.1 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  38.36 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09790  predicted transcriptional regulator  41.89 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829992  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0116  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  35.53 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1258  cadmium efflux system accessory protein  30.95 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  36.49 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  38.75 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  36.14 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0451  transcriptional regulator, ArsR family  39.73 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0352  transcriptional regulator, ArsR family  32.93 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  35.87 
 
 		 109 aa  47.4  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1304  transcriptional regulator, ArsR family  32.47 
 
 		 91 aa  47.4  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1126  ArsR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0458599  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  37.18 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0187  transcriptional regulator, ArsR family  41.54 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36710  transcriptional regulator, ArsR family  42.47 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.944272 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  38.36 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4437  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 120 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.352064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2059  arsenical resistance operon repressor  29.63 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  38.36 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  32.18 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1839  transcriptional regulator, ArsR family  45 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000260966  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.52 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2974  arsenical resistance operon repressor  29.63 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00402764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2966  arsenical resistance operon repressor  29.63 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2281  ArsR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.815157 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3189  arsenical resistance operon repressor  30.86 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1891  ArsR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 129 aa  45.4  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3199  arsenical resistance operon repressor  29.63 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  33.78 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1142  transcriptional regulator, ArsR family  36.71 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.629326  normal  0.465859 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  36.56 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0886  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0860  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4032  transcriptional regulator, ArsR family  35.44 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162446  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  34.25 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>