More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2281 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2281  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
116 aa  232  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.815157 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0187  transcriptional regulator, ArsR family  81.03 
 
 
127 aa  187  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6188  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  43.16 
 
 
121 aa  92.8  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  48.42 
 
 
119 aa  93.2  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2845  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 
140 aa  92  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  44.68 
 
 
119 aa  90.9  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  46.32 
 
 
120 aa  90.9  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00003097  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  42.71 
 
 
119 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  47.37 
 
 
124 aa  89  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  41.9 
 
 
123 aa  88.6  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  43.62 
 
 
121 aa  88.6  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 
125 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 
125 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 
125 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  43.62 
 
 
125 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  43.62 
 
 
125 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  43.62 
 
 
125 aa  87.4  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  43.62 
 
 
125 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  43.62 
 
 
125 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  43.62 
 
 
125 aa  87.4  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 
125 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  43.62 
 
 
125 aa  87  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  47.92 
 
 
119 aa  86.3  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 
120 aa  86.7  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
123 aa  85.5  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  36.61 
 
 
124 aa  85.1  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  41.41 
 
 
118 aa  85.1  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 
122 aa  85.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  36.61 
 
 
124 aa  85.1  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  44.79 
 
 
173 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  39.81 
 
 
119 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  41.59 
 
 
120 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  38.38 
 
 
120 aa  84  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  40.71 
 
 
125 aa  83.6  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1258  cadmium efflux system accessory protein  37.5 
 
 
122 aa  82.4  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1232  regulatory protein ArsR  42.11 
 
 
114 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.802092  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0100  ArsR family transcriptional regulator  51.06 
 
 
127 aa  82.4  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
124 aa  82  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  34.51 
 
 
125 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
125 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1719  transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 
122 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0548  transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 
122 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1137  transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 
122 aa  80.1  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  38.6 
 
 
120 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  38 
 
 
125 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1382  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
117 aa  78.2  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1470  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 
119 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967801  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2584  ArsR family transcriptional regulator  43.62 
 
 
127 aa  77  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1821  transcriptional regulator, ArsR family  41.41 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.321191  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  36.63 
 
 
123 aa  74.7  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 
125 aa  74.7  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  40.21 
 
 
135 aa  74.7  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  36.79 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  44.16 
 
 
117 aa  73.2  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  35.51 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4447  ArsR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  44.21 
 
 
124 aa  71.2  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  40.96 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2795  regulatory protein ArsR  34.62 
 
 
115 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2752  regulatory protein, ArsR  34.62 
 
 
115 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3238  Fis family transcriptional regulator  42.42 
 
 
127 aa  67  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 
120 aa  67  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4437  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
120 aa  67  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.352064  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 
125 aa  66.6  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0860  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2222  transcriptional regulator CadC  33.65 
 
 
115 aa  65.1  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.550657  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
123 aa  65.5  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1126  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0458599  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0886  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6743  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.661837 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  39.53 
 
 
102 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
223 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3766  cadmium efflux system accessory protein  35.24 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2544  transcriptional regulator, ArsR family  41.33 
 
 
130 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  47.3 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0480  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
120 aa  63.9  0.0000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0108431  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  40.54 
 
 
109 aa  63.2  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  45.12 
 
 
183 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  43.48 
 
 
112 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  39.78 
 
 
104 aa  62.8  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  43.48 
 
 
112 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5319  regulatory protein, ArsR  37.37 
 
 
127 aa  62  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5692  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
127 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1492  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
127 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2654  ArsR family transcriptional regulator  45.12 
 
 
109 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  39.73 
 
 
93 aa  61.6  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  34 
 
 
115 aa  61.6  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3682  regulatory protein, ArsR  36.36 
 
 
127 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0687886  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  43.04 
 
 
125 aa  61.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09790  predicted transcriptional regulator  36.47 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829992  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 
114 aa  61.2  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  46.38 
 
 
227 aa  61.6  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
129 aa  61.2  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  41.46 
 
 
123 aa  61.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>