More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0548 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0548  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
122 aa  246  6e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1137  transcriptional regulator, ArsR family  99.18 
 
 
122 aa  244  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1719  transcriptional regulator, ArsR family  98.36 
 
 
122 aa  242  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1258  cadmium efflux system accessory protein  78.69 
 
 
122 aa  204  2e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  70.09 
 
 
123 aa  183  8e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3766  cadmium efflux system accessory protein  56.03 
 
 
124 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1821  transcriptional regulator, ArsR family  55.75 
 
 
121 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.321191  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  51.33 
 
 
120 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00003097  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  45.3 
 
 
118 aa  99  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  43.1 
 
 
119 aa  99  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  45.79 
 
 
125 aa  94.7  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  46.55 
 
 
119 aa  94  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
120 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2795  regulatory protein ArsR  40.74 
 
 
115 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2752  regulatory protein, ArsR  40.74 
 
 
115 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  41.44 
 
 
123 aa  91.7  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  41.88 
 
 
119 aa  91.7  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  41.03 
 
 
121 aa  90.9  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 
173 aa  90.5  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  36.94 
 
 
135 aa  90.5  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
123 aa  89.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  40.87 
 
 
124 aa  87.8  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2222  transcriptional regulator CadC  38.89 
 
 
115 aa  88.2  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.550657  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  38.39 
 
 
120 aa  88.2  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  39.34 
 
 
124 aa  87  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  39.34 
 
 
124 aa  87  7e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2845  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
140 aa  86.3  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0187  transcriptional regulator, ArsR family  43.27 
 
 
127 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6188  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  38.74 
 
 
125 aa  85.5  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
117 aa  85.1  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2584  ArsR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
127 aa  84  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  37.72 
 
 
119 aa  83.6  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
124 aa  83.6  8e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  37.61 
 
 
121 aa  83.2  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  47.78 
 
 
125 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
120 aa  83.2  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
125 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
125 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
125 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
125 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  36.75 
 
 
125 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
125 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  36.75 
 
 
125 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  36.75 
 
 
125 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
125 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  36.75 
 
 
125 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4581  ArsR family transcriptional regulator  49.37 
 
 
132 aa  80.1  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  38.26 
 
 
125 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  39.5 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1470  transcriptional regulator, ArsR family  37.39 
 
 
119 aa  79  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967801  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
120 aa  79.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  35.96 
 
 
119 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
125 aa  79  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
122 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1232  regulatory protein ArsR  41.23 
 
 
114 aa  77.8  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.802092  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  32.48 
 
 
124 aa  78.2  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4447  ArsR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  45.24 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
122 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  39.22 
 
 
121 aa  77  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2832  regulatory protein, ArsR  36.84 
 
 
128 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.119331 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2281  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 
116 aa  74.7  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.815157 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  37.07 
 
 
125 aa  74.3  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1492  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.04 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 
120 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3682  regulatory protein, ArsR  36.46 
 
 
127 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0687886  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3096  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 
121 aa  72  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465743  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5319  regulatory protein, ArsR  35.42 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5692  ArsR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0100  ArsR family transcriptional regulator  35.04 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  38.61 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1382  ArsR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
117 aa  70.1  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  44.09 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  38.55 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2654  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
109 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
129 aa  68.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3138  regulatory protein ArsR  34.04 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
115 aa  68.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1126  ArsR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0458599  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  41.98 
 
 
123 aa  67.8  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 
117 aa  67.4  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1791  transcriptional regulator, ArsR family  34.45 
 
 
121 aa  67  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0994316  normal  0.491386 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  45.35 
 
 
102 aa  67.4  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1839  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 
146 aa  67  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000260966  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1965  ArsR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
120 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  43.21 
 
 
125 aa  66.6  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  32.74 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3238  Fis family transcriptional regulator  32.65 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0886  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09790  predicted transcriptional regulator  34.02 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829992  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1901  regulatory protein, ArsR  36.67 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0860  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4451  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  42.17 
 
 
118 aa  65.1  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  45 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3727  regulatory protein, ArsR  33.71 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438217  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1729  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
104 aa  64.3  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.618601  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>