More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1791 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1791  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
121 aa  235  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0994316  normal  0.491386 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1492  ArsR family transcriptional regulator  65.14 
 
 
127 aa  136  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  61.11 
 
 
120 aa  132  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2832  regulatory protein, ArsR  63.11 
 
 
128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.119331 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3682  regulatory protein, ArsR  62.14 
 
 
127 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0687886  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3096  transcriptional regulator, ArsR family  60.91 
 
 
121 aa  129  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465743  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5319  regulatory protein, ArsR  62.14 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5692  ArsR family transcriptional regulator  62.14 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3238  Fis family transcriptional regulator  56.03 
 
 
127 aa  121  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0907  regulatory protein, ArsR  63.89 
 
 
128 aa  121  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1821  transcriptional regulator, ArsR family  41.58 
 
 
121 aa  84.3  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.321191  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  40.4 
 
 
120 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00003097  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  41 
 
 
118 aa  78.2  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2845  transcriptional regulator, ArsR family  44.79 
 
 
140 aa  77  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1137  transcriptional regulator, ArsR family  34.45 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3766  cadmium efflux system accessory protein  41.18 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1719  transcriptional regulator, ArsR family  37 
 
 
122 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2584  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0548  transcriptional regulator, ArsR family  34.45 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0100  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  41.86 
 
 
121 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
125 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
125 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  40.96 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1258  cadmium efflux system accessory protein  34.65 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  40.96 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  33.67 
 
 
119 aa  72.8  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  48.96 
 
 
173 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  44.44 
 
 
119 aa  72  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  34.26 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  35.35 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  35.35 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 
125 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  34.34 
 
 
120 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  34 
 
 
125 aa  70.9  0.000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  43.3 
 
 
125 aa  70.9  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  40.57 
 
 
124 aa  70.5  0.000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  41.84 
 
 
125 aa  70.1  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  41.41 
 
 
135 aa  70.1  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  39.18 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  37.29 
 
 
123 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  39.76 
 
 
124 aa  70.1  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
123 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  44.79 
 
 
120 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1126  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
131 aa  68.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0458599  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1470  transcriptional regulator, ArsR family  47.22 
 
 
119 aa  67.8  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967801  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1232  regulatory protein ArsR  36.46 
 
 
114 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.802092  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0187  transcriptional regulator, ArsR family  39.6 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6188  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  40.95 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  36.08 
 
 
125 aa  65.5  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 
120 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  40.96 
 
 
119 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  36.46 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  40.2 
 
 
122 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  39.76 
 
 
119 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1382  ArsR family transcriptional regulator  42.68 
 
 
117 aa  63.2  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1033  transcriptional regulator, ArsR family  32.97 
 
 
108 aa  63.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  47.62 
 
 
122 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4581  ArsR family transcriptional regulator  40.19 
 
 
132 aa  62.8  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  41.84 
 
 
129 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  49.21 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0506  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
118 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  44.59 
 
 
118 aa  62  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2654  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4447  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  43.02 
 
 
120 aa  62.8  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 
126 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  45.24 
 
 
337 aa  62.4  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1719  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
119 aa  62  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  38.38 
 
 
120 aa  61.6  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 
113 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 
93 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 
117 aa  61.6  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  32 
 
 
121 aa  61.6  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  43.02 
 
 
120 aa  61.6  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  47.83 
 
 
119 aa  61.6  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3728  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
119 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369834  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2679  regulatory protein ArsR  44.87 
 
 
120 aa  60.8  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00320886  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  43.59 
 
 
120 aa  60.8  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  46.05 
 
 
115 aa  60.8  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  46.25 
 
 
119 aa  60.5  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  43 
 
 
123 aa  60.1  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  33.67 
 
 
123 aa  60.1  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4451  ArsR family transcriptional regulator  39.56 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  44.3 
 
 
122 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
115 aa  58.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1707  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
119 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000753333  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3344  transcriptional regulator, MarR family  39.81 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  48.48 
 
 
317 aa  58.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  44.3 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>