More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1707 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1707  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
119 aa  244  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000753333  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1719  ArsR family transcriptional regulator  95.8 
 
 
119 aa  219  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 
111 aa  72.8  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
121 aa  69.3  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  41.03 
 
 
87 aa  68.2  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  39.02 
 
 
95 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  39.02 
 
 
95 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 
119 aa  65.5  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4201  ArsR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
94 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314782  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  37.8 
 
 
95 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
95 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
95 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  36.71 
 
 
115 aa  62.8  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
120 aa  62.4  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3418  regulatory protein ArsR  38.67 
 
 
99 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.799155  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  38.1 
 
 
98 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  35.87 
 
 
93 aa  62  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  36.71 
 
 
92 aa  61.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  43.66 
 
 
102 aa  61.6  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  32.22 
 
 
108 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1407  regulatory protein, ArsR  39.13 
 
 
92 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142872  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  37.18 
 
 
133 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  28.42 
 
 
258 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
148 aa  60.5  0.000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3941  regulatory protein ArsR  37.33 
 
 
99 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4498  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 
103 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  37.33 
 
 
94 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  32.97 
 
 
111 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  36.56 
 
 
124 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
115 aa  58.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  34.94 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  28.44 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  36.56 
 
 
124 aa  59.3  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  38.96 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
123 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
105 aa  58.2  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  40.79 
 
 
107 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  41.79 
 
 
102 aa  58.2  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  40.79 
 
 
107 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  30.53 
 
 
125 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
102 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  31.82 
 
 
105 aa  57.8  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4063  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4671  ArsR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
119 aa  57.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 
119 aa  57.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  34.26 
 
 
117 aa  57.4  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  28.42 
 
 
105 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3819  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
120 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  36.23 
 
 
120 aa  57.8  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0208  transcriptional regulator, ArsR family  31.46 
 
 
133 aa  57.4  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  40.3 
 
 
94 aa  57  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
116 aa  57  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5377  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 
109 aa  57  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3414  ArsR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
111 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  27.16 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  33.71 
 
 
119 aa  56.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
109 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 
120 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0423  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 
128 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.72 
 
 
113 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0013  regulatory protein, ArsR  34.21 
 
 
127 aa  56.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  39.19 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  32.97 
 
 
106 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  39.13 
 
 
105 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  36.71 
 
 
112 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  37.33 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
125 aa  55.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  35.06 
 
 
124 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16640  hypothetical protein  40.3 
 
 
266 aa  55.1  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  31.94 
 
 
183 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
120 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
101 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  34.12 
 
 
116 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
120 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  32.47 
 
 
122 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  34.67 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
120 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12384  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1644  ArsR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
97 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1936  ArsR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
97 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
108 aa  54.7  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  36.99 
 
 
133 aa  54.7  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  36.62 
 
 
107 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0417  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
115 aa  54.3  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
115 aa  53.9  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
107 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2434  transcriptional regulator, ArsR family  31.03 
 
 
111 aa  53.9  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  33.71 
 
 
118 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  39.13 
 
 
103 aa  53.9  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
112 aa  53.9  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0470  transcriptional regulator, ArsR family  35.06 
 
 
134 aa  53.9  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>