More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0187 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0187  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 127 aa  255  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2281  ArsR family transcriptional regulator  81.03 
 
 		 116 aa  176  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.815157 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  44.04 
 
 		 121 aa  98.6  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  42.99 
 
 		 119 aa  93.6  9e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  42.06 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  42.06 
 
 		 119 aa  91.3  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2845  transcriptional regulator, ArsR family  41.8 
 
 		 140 aa  90.5  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  41.9 
 
 		 173 aa  89.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  42.99 
 
 		 119 aa  87.8  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 123 aa  87.4  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  41.74 
 
 		 122 aa  87.4  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 125 aa  87.4  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0548  transcriptional regulator, ArsR family  43.27 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1137  transcriptional regulator, ArsR family  43.27 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  39.25 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  39.25 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  43.14 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  42.99 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1719  transcriptional regulator, ArsR family  43.27 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  41.58 
 
 		 123 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  41.41 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  41.75 
 
 		 120 aa  85.5  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00003097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  42.2 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1258  cadmium efflux system accessory protein  40.57 
 
 		 122 aa  84  6e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  39.66 
 
 		 120 aa  84  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0100  ArsR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  38.32 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2584  ArsR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1232  regulatory protein ArsR  41.9 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.802092  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  42.55 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  36.11 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  35.4 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  35.4 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  41.49 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  44.04 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  37.96 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  38.61 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1382  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  42.55 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  37.96 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1821  transcriptional regulator, ArsR family  36.19 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.321191  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  39.36 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1470  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967801  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  36.7 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2544  transcriptional regulator, ArsR family  35.51 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  44.16 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4447  ArsR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  38.64 
 
 		 123 aa  67  0.00000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1390  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 137 aa  67  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000534285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4437  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.352064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6743  transcriptional regulator, ArsR family  34.31 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.661837 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2752  regulatory protein, ArsR  35 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2795  regulatory protein ArsR  35 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0886  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3238  Fis family transcriptional regulator  40 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0860  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1126  ArsR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0458599  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  41.46 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  40.96 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  39.02 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3682  regulatory protein, ArsR  36.27 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0687886  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  41.46 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2222  transcriptional regulator CadC  35 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.550657  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1492  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 127 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3766  cadmium efflux system accessory protein  36.84 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5319  regulatory protein, ArsR  36.27 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5692  ArsR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 223 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3096  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465743  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1168  transcriptional regulator, ArsR family  33.65 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315565  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 297 aa  60.1  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  31.13 
 
 		 108 aa  60.1  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  31.96 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  43.06 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>