More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1459 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1459  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 129 aa  268  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1468  ArsR family transcriptional regulator  61.68 
 
 		 111 aa  142  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3259  ArsR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 138 aa  95.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1702  transcriptional regulator, ArsR family  41.35 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000822998 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3748  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 118 aa  85.9  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1794  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0757  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.164852 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0763  transcriptional regulator, ArsR family  42.55 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2424  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 118 aa  82  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2984  transcriptional regulator, ArsR family  41.35 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0866  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.799603  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2313  ArsR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0623  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2154  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2632  ArsR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  43.53 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  43.82 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1891  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1704  transcriptional regulator, ArsR family  44.32 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809199  hitchhiker  0.000421597 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3135  ArsR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4852  transcriptional regulator, ArsR family  36.97 
 
 		 114 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0476  transcriptional regulator, ArsR family  37.76 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3703  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3756  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.965498 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2439  ArsR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.985775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  38.04 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0432  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.714368 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  37.5 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29211  regulatory proteins, ArsR family protein  37.23 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4684  ArsR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.504517  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  39.56 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  39.53 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36710  transcriptional regulator, ArsR family  34.58 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.944272 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4063  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0454  ArsR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  33.72 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0938  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09790  predicted transcriptional regulator  38.37 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829992  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  34.23 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  34.04 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2135  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  2.25327e-28  decreased coverage  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8471  transcriptional regulator, ArsR family  38.2 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4262  ArsR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.264931  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1714  transcriptional regulator, ArsR family  35.51 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388978  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  36.84 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  34.74 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2721  regulatory protein ArsR  36.26 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  29.79 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1126  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0458599  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 122 aa  57  0.00000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  34.09 
 
 		 112 aa  57  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0327  regulatory protein ArsR  33 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.395704  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  34.09 
 
 		 112 aa  57  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2040  transcriptional regulator, ArsR family  36.71 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  30.68 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  32.61 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  30.68 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  36.25 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0894  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  33.73 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1108  ArsR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1504  transcriptional regulator, TrmB  41.05 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  29.09 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  32.26 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  38.16 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  32.26 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0687  ArsR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1782  ArsR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>