More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4262 on replicon NC_008539
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008539  Arth_4262  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
121 aa  243  6e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.264931  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36710  transcriptional regulator, ArsR family  66.36 
 
 
144 aa  143  8.000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.944272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3727  regulatory protein, ArsR  53.91 
 
 
137 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438217  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10842  transcriptional regulator  55.66 
 
 
130 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.67021e-19  hitchhiker  0.000000379454 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3224  regulatory protein, ArsR  56.14 
 
 
136 aa  118  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.930108  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1901  regulatory protein, ArsR  52.21 
 
 
141 aa  114  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1488  ArsR family transcriptional regulator  51.28 
 
 
151 aa  114  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1510  ArsR family transcriptional regulator  51.28 
 
 
151 aa  114  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836055  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3138  regulatory protein ArsR  58.76 
 
 
127 aa  114  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1486  ArsR family transcriptional regulator  51.28 
 
 
138 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  50 
 
 
135 aa  91.3  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3728  regulatory protein, ArsR  48.39 
 
 
119 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369834  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8471  transcriptional regulator, ArsR family  46.32 
 
 
130 aa  85.5  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1714  transcriptional regulator, ArsR family  42.57 
 
 
119 aa  80.1  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388978  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4286  transcriptional regulator, ArsR family  44.55 
 
 
118 aa  79  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.30031  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  40.59 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09790  predicted transcriptional regulator  43.01 
 
 
145 aa  72  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829992  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  36.36 
 
 
119 aa  72  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  45.57 
 
 
119 aa  71.6  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  35.23 
 
 
119 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  44.68 
 
 
173 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4581  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  35.16 
 
 
102 aa  70.5  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  36.84 
 
 
123 aa  70.1  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3827  ArsR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 
122 aa  67.4  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4451  ArsR family transcriptional regulator  46.51 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2354  transcriptional regulator, ArsR family  43 
 
 
114 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000229656  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  42.73 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2632  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5816  transcriptional regulator, ArsR family  41.05 
 
 
129 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3726  ArsR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  33.75 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  41.77 
 
 
119 aa  63.9  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  37.37 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  33.75 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
124 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2292  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
99 aa  63.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.863307  hitchhiker  0.000000172581 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
123 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1382  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
117 aa  62.8  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  43.04 
 
 
120 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
114 aa  62.8  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  38.2 
 
 
118 aa  62.4  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  32.95 
 
 
133 aa  61.6  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  38.27 
 
 
118 aa  61.2  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  29.55 
 
 
125 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2654  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
109 aa  60.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  32.61 
 
 
102 aa  60.5  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  41 
 
 
124 aa  60.5  0.000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  36.49 
 
 
93 aa  60.1  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0771  regulatory protein ArsR  32.14 
 
 
98 aa  59.7  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00625866  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  34.09 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  34.09 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  29.89 
 
 
120 aa  60.1  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  35.9 
 
 
87 aa  60.1  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3748  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
118 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  34.09 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2721  regulatory protein ArsR  43.66 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  41.33 
 
 
122 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  33.72 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1821  ArsR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
110 aa  59.3  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0345143  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1580  regulatory protein ArsR  37 
 
 
115 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0014541  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  35.06 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2907  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
122 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.160792 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1126  ArsR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0458599  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4437  ArsR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.352064  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1182  regulatory protein, ArsR  36.36 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  34.48 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  34.09 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  38.64 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  31.91 
 
 
119 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  31.03 
 
 
100 aa  58.2  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1459  ArsR family transcriptional regulator  40.51 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228644  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  44.12 
 
 
117 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2424  ArsR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
118 aa  58.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1470  transcriptional regulator, ArsR family  36.78 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967801  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0723  ArsR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  36.78 
 
 
120 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00003097  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  37 
 
 
106 aa  57.8  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07760  predicted transcriptional regulator  38.46 
 
 
120 aa  58.2  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.853788  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  30.95 
 
 
125 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  29.55 
 
 
121 aa  57.4  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
122 aa  57.8  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1516  transcriptional regulator, ArsR family  31.63 
 
 
111 aa  57.4  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000659197  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2845  transcriptional regulator, ArsR family  34.91 
 
 
140 aa  57.4  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1755  transcriptional regulator CzrA  32.56 
 
 
113 aa  57  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.952937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>